Establishment of a method for the detection of proviral cDNA of HERV-K(HML-2)
Mirjam Yasemine Langenegger, Robert Koch-Institut, Robert Koch-Institut
2018
Humane endogene Retroviren (HERVs) konnten viele Millionen Jahre lang Proviren in die menschliche Keimbahn integrieren. Jedoch führten im Laufe der Jahre Mutationen, Deletionen und Rekombinationen zu deren Inaktivierung. Heute haben alle bekannten HERV-Proviren die Fähigkeit zur Replikation eingebüßt. Jedoch wurden Transkripte und virale Partikel einer HERV-Gruppe (HERV-K(HML-2)) in verschiedenen kranken menschlichen Geweben nachgewiesen. Vorangegangene Studien mit rekonstruierten
more »
... Viren konnten eine Infektion in gewissen Zelllinien nachweisen. Jedoch konnte keine Integration gemessen werden, was einen post-Entry, pre-Integrations-Block vermuten lässt. Bei welchem Schritt nach dem Zelleintritt dieser Block auftritt und welche zellulären Faktoren daran beteiligt sind ist unbekannt. In der vorliegenden Arbeit wurde versucht, in infizierten Zellen HERV-K(HML-2) cDNA nachzuweisen als Hinweis auf Reverse Transkription. Untersuchungen zum Infektionsprozess von HERV-K(HML-2) mittels Plasmid-basierenden Reporterviren wurden in der Vergangenheit bereits unternommen. Jedoch bestand das Problem, dass die cDNA, also das Produkt der Reversen Transkription, nicht unterschieden werden konnte von der kontaminierenden Plasmid-DNA. Als Lösung hierfür bot sich an, eine bestimmte Mutation in die Plasmid-DNA einzufügen, welche sich –durch intramolekulare Umlagerungen während der Reversen Transkription- verdoppelt und inder cDNA gleich zwei Mal vorhanden ist. Die cDNA unterscheidet sich so in ihrer Sequenz von der Plasmid-DNA und kann mit spezifischen Primern detektiert werden. Dieses mutierte Plasmid wurde in einer vorangehenden Arbeit hergestellt und nun als Vorlage für die Produktion von HERV-K(HML-2) Reporterviren genutzt. In der vorliegenden Arbeit wurden HERV-K(HML-2) und HIV-1 Reporterviren hergestellt, welche mit zwei unterschiedlichen Hüllproteinen, Env VSV-G und HIV-1 ΔKS, pseudotypisiert wurden. Es konnte gezeigt werde, dass mit Env VSV-G pseudotypisierte Reporterviren hochinfektiös sind, während Reporterviren [...]
doi:10.25646/5359
fatcat:ilwzk3vl75g2pb5ors5hnmetdq