Docking de protéines en réalité virtuelle. Une approche hybride et multimodale

Nicolas Férey, Guillaume Bouyer, Christine Martin, Abdelhamid Drif, Patrick Bourdot, Mehdi Ammi, Julien Nelson, Jean-Marie Burkhart, Ludovic Autin
2009 Techniques et sciences informatiques  
Le docking de protéines in-silico est la détermination de la structure 3d des complexes protéiques à l'échelle atomique, qui permet de mieux comprendre la fonction biologique de ces complexes. Dans le cadre du projet ANR CoRSAIRe, notre hypothèse est que les interactions multimodales en Réalité Virtuelle (RV) sont susceptibles d'améliorer la rapidité de ces dockings. A cet effet, nous avons conduit une analyse ergonomique afin d'identifier les besoins des biologistes sur les systèmes de docking
more » ... actuels. Puis nous avons conçu un modèle et une application immersive et multimodale dans laquelle les rendus visuel, audio et haptique sont combinés pour transmettre les informations nécessaires à ce type d'activité. ABSTRACT. Protein docking studies how proteins combine with each other in 3d, in order to better understand their biological functions. The basic hypothesis of the french research projet CoR-SAIRe is that Virtual Reality (VR) multimodal interactions can increase efficiency in reaching docking solutions. To this end, we have conducted an ergonomic analysis of the protein-protein current docking task. Using these results, we have designed an immersive and multimodal application where visual, audio and haptic feedbacks are combined to communicate biological information, help manipulating proteins and exploring possible solutions of assembly. MOTS-CLÉS : Docking, Conception Centrée Utilisateur, Réalité Virtuelle, Rendus Multimodaux KEYWORDS: Docking, User-Centered Design, Virtual Reality, Multimodal Rendering 2 e soumission à RSTI, le 03/09/08 1. Dans la suite de cet article nous emploierons l'anglicisme "docking", largement accepté dans la communauté des biologistes francophones.
doi:10.3166/tsi.28.983-1015 fatcat:n3ysxc7wzbc3naa5ojq2l7u7mm