DNS transzpozon alapú gémbeviteli eljárások vizsgálata emlős rendszerekben
Orsolya Kolacsek, Tamás Orbán
2016
Aza: 5-Aza-cytidine CAG: kompozit promóter (CMV enhancer -chicken β-actin -rabbit β 1 -globin) cDNS: RNS reverz transzkripciójával előállított DNS (complementary DNA) CMV: citomegalovírus promótere Ct: qPCR során mért fluoreszcencia küszöbérték, ciklusszám (threshold cycle) Cre: Cre rekombináz DDE(D): transzpozáz család katalitikus helyét kialakító aminosavak jelölése (Asp, Asp, Glu(Asp)) DR: (direct repeat) DSB: (douple stranded break) dsDNS: (double stranded DNA) FACS: (fluorescence-activated
more »
... cell sorting) FLP: FLP rekombináz for: (forward) FRT: FLP rekombináz által processzálódó szekvencia gDNS: genomiális DNS GFP: (green fluorescent protein) HEK-293: (human embryonic kidney 293) HeLa: méhnyakrák sejtvonal (Henrietta Lacks) HSC: (hematopoietic stem cell) HUES9: (human embryonic stem cell 9) hyPB: (hyperactive PB) iPS: (induced pluripotent stem cell) IS: (insertion sequence) ITR: (inverted terminal repeat) IRDR: (inverted repeat direct repeat) IRDR-L: (IRDR-Left) IRDR-R: (IRDR-Right) kb: kilóbázis LINE: (long interspersed nucleotide elements) lox: Cre rekomibnáz által processzálódó szekvencia (loxP) LTR: (long terminal repeat) 5 L1: (LINE-1) MITE: (miniature inverted-repeat transposable element) mp: másodperc mPB: egérre kodonoptimalizált PB NHEJ: (nonhomologous end joining) OPI: (overproduction inhibition) ORF: (open reading frame) pA: elsődleges RNS transzkriptum terminációját és poliadenilációját kiváltó szignál (polyA) PB: (piggyBac) PBS: (primer binding site) PCR: (polymerase chain reaction) PEC: (Paired End Complex) PGK: foszfo-glicerát kináz gén promótere piRNS: Piwi fehérjével interaktáló kis RNS POL: (DNA polymerase) qPCR: (quantitative PCR) qRT-PCR: (quantitative reverse transcription PCR) RC: (rolling-circle) rev: (reverse) RT/En: (reverse transcriptase / endonuclease) RNáz: ribonukleáz RPPH1: RNáz P H1 RNS komponense RQ: (relative quantity) SB: (Sleeping Beauty) SEC: (Single End Complex) S-NEC: (Synapsis by Naked End Capture) SV40: simian virus 40 promótere TSA: trichostatin A TSD: (target site duplication) V(D)J: (variable diversity joining) 3'UTR: (3' untranslated region) 5'UTR: (5' untranslated region)
doi:10.15476/elte.2016.170
fatcat:jk277fsurngc3p4cqbw6rwsjlu