Detection of population trends in threatened coho salmon (Oncorhynchus kisutch)
Katriona Shea, Marc Mangel
2001
Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences
Populations of coho salmon (Oncorhynchus kisutch) in California are listed as threatened under the U.S. Endangered Species Act. Such listings refer to adult populations, but often, juvenile life history stages are censused, so it is important to understand what affects the relationship between true adult and observed juvenile numbers. We present models to address how observational uncertainty, census length, and autocorrelation in vital rates affect our ability to observe trends. We ask two
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... tions about our ability to detect declines in one life history stage from censuses of another. First, given an observed decline in parr numbers, what is the chance that this reflects a decline in adults? Second, given that adult numbers are declining, what is the chance that we see that decline in parr? Our results indicate that statistical power decreases with increasing observational uncertainty and decreasing census lengths and demonstrate how these two parameters interact. Power increases as the level of autocorrelation in mortality rates increases. Management recommendations include obtaining more accurate estimates of autocorrelation in mortality and of observational uncertainty. Résumé : Les populations du Saumon coho (Onchorhynchus kisutch) de la Californie apparaissent sur la liste des espèces vulnérables conformément à la loi américaine sur les espèces menacées. Cette désignation concerne les populations d'adultes; comme il y a souvent des stades plus jeunes qui sont inclus dans les inventaires, il importe de comprendre les détails de la relation qui unit les nombres des vrais adultes et les nombres observés de jeunes. Des modèles permettent de comprendre comment l'incertitude des observations, la durée des inventaires et l'autocorrélation dans les taux vitaux affectent notre habileté à observer les tendances. Nous posons deux questions sur la possibilité de détecter les déclins dans un stade du cycle biologique à partir d'inventaires faits sur un autre stade. Premièrement, quelle est la probabilité d'avoir un déclin dans la densité des adultes lorsqu'on observe une diminution des densités des tacons? Puis, quelle est la probabilité de discerner chez les tacons un déclin qui se produit chez les adultes? Nos résultats montrent que la puissance statistique diminue lorsque l'incertitude des observations augmente et la durée des inventaires diminue; ils illustrent aussi l'interaction entre les deux variables. La puissance croît à mesure que l'autocorrélation entre les taux de mortalité augmente. Pour fins d'aménagement, nous recommandons d'obtenir des estimations plus précises de l'autocorrélation de la mortalité, ainsi que de l'incertitude des observations. [Traduit par la Rédaction] Shea and Mangel 385 Fig. 2. Possibility tree for the trends in coho salmon true adult population and observed parr population sizes. Population trajectories for each can either increase (8), remain the same (®), or decline (9). Thus, for example, Pr{A9} denotes the probability of a decline in true adult numbers, Pr{P obs ® } denotes the probability of the observed parr population size remaining constant, Pr{A8, P obs 8} denotes the probability that observed parr and true adult populations both increase, and Pr{P obs 9|A9}denotes the probability that we observe a decline in parr given a decline in the true adult population. See Fig. 3 for a specific example.
doi:10.1139/cjfas-58-2-375
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