Comparative analysis of 16S ribosomal RNA of Candidatus Liberibacter asiaticus associated with Huanglongbing disease of Persian lime and Mexican lime reveals a major haplotype with worldwide distribution
English

A. Moreno-Enrquez, Y. Minero-Garca, J. H. Ramrez-Prado, E. Loeza-Kuk, A. Uc-Varguez, O. A. Moreno-Valenzuela
2014 African Journal of Microbiology Research  
Progress and spatial pattern of huanglongbing in Persian lime in Nayarit, Mexico Progreso y patrón espacial del huanglongbing en limón Persa en Nayarit, México El Huanglongbing (HLB), ocasionado por Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas), causa pérdidas severas a los productores de cítricos (Citrus spp.) en México desde que se detectó por primera vez en 2009. Este estudio tuvo como objetivo analizar el progreso temporal y espacial de la enfermedad en cuatro huertos comerciales de limón Persa
more » ... les de limón Persa con presencia de HLB en Xalisco, Nayarit, México. La evaluación de la incidencia de la enfermedad se realizó mediante inspección visual de todos los árboles durante seis meses. Las epidemias fueron ajustadas con el modelo flexible de Weibull (y= 1-[t/b] c ), con respecto a la incidencia inicial (y 0 ), incidencia final (y f ), tasa de progreso de la enfermedad (b -1 ), y área bajo la curva del progreso de la enfermedad (AUDPC). El arreglo espacial de la enfermedad fue analizado mediante mapas geoestadísticos interpolativos, ordinary runs y ajuste a la distribución beta-binomial. El análisis de las curvas de progreso de la enfermedad mostró que la epidemia fue más rápida en la huerta ED-2, asociado a una proporción de incidencia inicial mayor, árboles relativamente jóvenes (<3 años) y posiblemente a una mayor exposición Huanglongbing (HLB), caused by Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas), causes severe losses to citrus (Citrus spp.) growers in Mexico since it was first detected in 2009. This study aimed at analyzing the temporal and spatial progression of the disease at four commercial orchards with HLB presence cultivated with Persian lime (Citrus latifolia Tanaka) located in Xalisco, Nayarit, Mexico. The evaluation of the disease incidence was done by visual inspection of all trees for six months. The epidemics were fitted through the flexible model Weibull (y= 1-[t/b] c ), with respect to initial incidence (y 0 ), final incidence (y f ), rate of disease progression (b -1 ), and area under disease progress curve (AUDPC). The spatial pattern of the disease was analyzed by geostatistical maps, "ordinary runs" and fitting the beta-binomial distribution. The analysis of the progress Cite this paper/Como citar este artículo:
doi:10.5897/ajmr2014.6706 fatcat:s6eqozlrlfdtdpodt73cdpmydq