Ontologia Probabilística para Auxiliar na Recuperação de Modelos Biológicos

Wladimir Pereira, Kate Revoredo
2012 Joint Seminar on Ontology Research in Brazil / International Workshop on Metamodels, Ontologies and Semantic Technologies  
The Cell Component Ontology (CelO), an ontology expressed in OWL-DL that describes semantically biological models associated with the context of electrophysiology, has no support for dealing with uncertainty. It is demonstrated in this paper that a computational environment based on ontologies (CelO) and Bayesian Networks can help researchers in the modeling phase of the cycle of experimental knowledge of Biology, retrieving accurately biological models. Resumo. A Cell Component Ontology
more » ... uma ontologia expressa em OWL-DL que possibilita expressar a semântica de modelos biológicos associados ao contexto da eletrofisiologia, não possui suporte para lidar com a incerteza. É demonstrado neste trabalho que um ambiente computacional baseado em ontologias (CelO) e Redes Bayesianas é capaz de auxiliar o pesquisador na fase de modelagem do ciclo experimental de conhecimento da Biologia, recuperando modelos biológicos de uma maneira mais precisa. Introdução Em [Matos et al. 2010 ] foi apresentada a Cell Component Ontology (CelO), uma ontologia expressa em OWL-DL que é derivada da CellML [Cuellar et al. 2003 ], uma linguagem de marcação baseada em XML (eXtensible Markup Language) [Bray et al. 2000 ] criada especificamente com o propósito de descrever variáveis, equações e componentes de modelos biológicos de maneira formal, sem ambiguidades, legível por humanos e processável por máquinas. Cada modelo CellML é composto por uma rede de componentes interconectados, que é a menor unidade funcional do modelo, e por variáveis, que são entidades que têm como propósito representar quantidades usadas nas equações. Além disso, há as conexões, que mapeiam variáveis entre componentes, permitindo a troca de informações entre eles. A Figura 1 mostra um esquema dos elementos que compõem um modelo CellML. 1 Esse trabalho faz parte do escopo do projeto "Infraestrutura de apoio a Gerência de experimentos científicos em Modelagem Computacional" com apoio do CNPQ (número 559998/2010-4
dblp:conf/ontobras/PereiraR12 fatcat:2tt3h2o7xngbzon7d7jx52jupy