Haloferax larsenii sp. nov., an extremely halophilic archaeon from a solar saltern

X.-W. Xu, Y.-H. Wu, C.-S. Wang, A. Oren, P.-J. Zhou, M. Wu
2007 International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology  
İzmir Çamaltı Saltern is the biggest seawater-based saltern in Turkey. To date, it has not been investigated extensively for the existence of poly-3-hydroxybutyrate (PHB)-producing species. In this study, 14 extremely halophilic archaea were isolated, purifi ed, and screened for PHB production. One strain was then selected as the best PHB producer, further cultivated in diff erent PHB media, and compared with a positive control, Haloferax mediterranei ATCC 33500. PHB was extracted from cells
more » ... measured with a spectrophotometer, and then the amount of PHB was measured through comparison with standard PHB. Th e detected high PHB yield was 6.53% of the dry cell weight in the PHB medium supplemented with acetate. Partial 16S rRNA gene sequence analysis showed 99% similarity to Haloferax alexandrinus strain TM T ; therefore, the strain was named Haloferax sp. MA10. Haloferax sp. MA10 and Haloferax alexandrinus TM T have some diff erences in phenotypic and biochemical properties. With this study, the discovery of PHB-producing extreme halophilic archaeon Haloferax sp. MA10 at İzmir's Çamaltı Saltern is reported for the fi rst time. Key words: Extremely halophilic archaeon, poly-3-hydroxybutyrate (PHB), PHB extraction and quantifi cation, Haloferax sp. MA10, 16S rRNA gene İzmir Çamaltı Tuzlası'ndan izole edilen poli-3-hidroksibütirat üreticisi ekstrem halofi lik arkeon: Haloferax sp. MA10 Özet: İzmir Çamaltı Tuzlası, Türkiye'nin deniz suyu kökenli en büyük tuzlası olma özelliğindedir. Günümüze kadar bu bölgede poli-3-hidroksibütirat (PHB) üretici türün varlığı bakımından çok fazla araştırma yapılmamıştır. Bu kapsamda, on dört ekstrem halofi lik arkea izole edilmiş, safl aştırılmış, PHB üretip üretmedikleri saptanmış ve bir suş en iyi PHB üreticisi olarak seçilerek PHB üreticisi Haloferax mediterranei ATCC 33500 pozitif kontrol ile karşılaştırmak suretiyle değişik PHB besiyerlerinde büyütülmüştür. PHB hücrelerden ekstrakte edilmiş, spektrofotometre ile ölçülmüş ve PHB miktarı standart PHB ile karşılaştırılarak tespit edilmiştir. En yüksek PHB veriminin asetat içeren PHB ortamında hücre kuru ağırlığının % 6,53'ü olarak saptanmıştır. Kısmi 16S rRNA gen dizisi analiz sonucu % 99 oranında Haloferax alexandrinus TM T suşuna benzer olduğunu göstermiştir. Bu nedenle suş Haloferax sp. MA10 olarak adlandırılmış olup Haloferax sp. MA10'ın, bazı fenotipik ve biyokimyasal özellikler bakımından Haloferax alexandrinus TM T suşundan farklılıkları olduğu bulunmuştur. Bu çalışma ile İzmir Çamaltı Tuzlası'ndan PHB-üretici ekstrem halofi lik arkeon Haloferax sp. MA10 ilk defa bulunmuştur. Anahtar sözcükler: Ekstrem halofi lik arkeon, poli-3-hidroksibütirat (PHB), PHB ekstraksiyonu ve kantifi kasyonu, Haloferax sp. MA10, 16S rRNA geni Poly-3-hydroxybutyrate-producing extreme halophilic archaeon: Haloferax sp. MA10 isolated from Çamaltı Saltern, İzmir
doi:10.1099/ijs.0.64573-0 pmid:17392193 fatcat:pf52b6svtray5hryb7x5etq2gi