Marcação de regiões de interesse em 3d sobre imagens radiológicas utilizando a web [thesis]

Cleber Castro Hage
Agradecimentos Agradeço, primeiramente, aos meus pais, Elias Hage Junior e Maria da Graça Castro Hage, pelos exemplos e ensinamentos sem os quais eu não chegaria aonde pude e poderei chegar. O contínuo apoio e incentivo de minha família, especialmente de meus pais, para continuação de meus estudos foram de suma importância para definição de meus objetivos de vida, incluindo minha inserção no mundo acadêmico e realização deste trabalho de pesquisa. Agradeço também à minha irmã, Gracielli Castro
more » ... age-Kautz que, com seus exemplos de vida acadêmica, me deu forças na realização de meus trabalhos e sempre me ajudou nos momentos difíceis. Quero agradecer à minha esposa maravilhosa, Sabrina Di Salvo Mastrantonio, por ser exemplo e por não me deixar perder o ânimo diante dos obstáculos. Minha família é a fonte de minha energia. Dedico um agradecimento especial ao Prof. Dr. Dilvan de Abreu Moreira que, com seu apoio, me deu a oportunidade de voltar ao mundo acadêmico por meio deste trabalho. Sempre serei grato por seus conselhos e por sua motivação que vão além da orientação deste trabalho. Levarei seus ensinamentos comigo. Meu obrigado também à sua equipe de pesquisa que proporcionou um ambiente de colaboração admirável, incluindo a equipe de pesquisa do Meu agradecimento a todos os meus colegas do ICMC, especialmente ao Kleberson Junio do Amaral Serique que me ajudou no desenvolvimento deste trabalho. Agradeço também ao Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação e à Universidade de São Paulo pela estrutura oferecida para realização deste projeto. Abstract This work is part of a larger project, the electronic Physician Annotation Device (ePAD) project. The ePAD allows the creation of a medical knowledge base using semantic annotation on lesions found on radiological images using the Web platform. The annotation will serve to identify, follow-up and reason about tumor lesions in medical research projects (specially about cancer). The information acquired and persisted by the system allows automatic evaluation by computers; retrieval of hospital images and other services related to medical exams. ePAD is a joint development of the ICMC-USP and the Department of Radiology of the Stanford University research groups. The main work, presented here, is a new set of functionalities on the Web to add recording of lesions on radiological images in three dimensions to ePAD. They will lead to more accurate data about three dimensional lesion measurements, such as volume, position and longest diameter calculations. The objective is to ease the work of radiology professionals doing diagnostic analysis and lesion tracking producing more accurate follow-ups of disease evolution, such as of cancer. Annotation can be attached to lesions and hold semantic information, using biomedical ontology terms from RadLex. These new functionalities are based on HTML5 with the help of WebGL for visualization and manipulation of 3D objects. The main contributions of this work are the software for visualization of radiological image series in 3D using orthogonal planes, the video prototypes showing the three possible interfaces to mark lesions in 3D, the survey with radiologists (using the video prototypes) to determine that the spherical cursor was the best interface to mark lesions in 3D and the prototype of this interface in ePAD. This work received help from users
doi:10.11606/d.55.2014.tde-19032015-104453 fatcat:qekzu6k4h5cpbppk7qxdewfwq4