A atividade política do padre Marcos Vaz Preto foi intensa e coincidiu com o espaço temporal que fica entre as duas regenerações, a de 1820 e a de 1851. Foi figura central da reforma eclesiástica que o liberalismo levou a cabo em Portugal, facto que não lhe tem sido muito abonatório, dado tratar-se de um sacerdote. O padre Marcos quis compreender o seu tempo: pensou, discutiu, tomou partido, defendeu ideias e opôs-se a tantas outras, correu riscos, agiu, decidiu e justificou-se sempre.

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... crente, romântico e liberal, nem sempre esteve ao lado das opções políticas adotadas pela Igreja, principalmente quando esta, não entendendo que o tempo da história era outro, foi apoiando todas as propostas de regresso ao passado, mesmo quando as nações nelas não se reviam. A Igreja perdeu a oportunidade histórica de ser uma das autoras, a par da nação, do novo regime constitucional: era representativa, confundia-se com os valores nacionais e era por ela aceite. O nome do padre Marcos honrou a Igreja e a Maçonaria, honrou a liberdade e os princípios constitucionais, mas honrou ainda mais a nação e a sua religião.