Αξιολόγηση εξονικών πολυμορφισμών σε CpG αλληλουχίες και ενισχυτές ματίσματος σε γονίδια που συνδέονται με διαβήτη τύπου ΙΙ: διερεύνηση σε Ελληνικό πληθυσμό

Μαρία Ε. Καραμπατάκη
2015
Οι σύγχρονες γνώσεις στο πεδίο της λειτουργικής γονιδιωματικής επιτρέπουν την πληρέστερη αξιολόγηση των γενετικών μεταβολών που επηρεάζουν την έκφραση, και συγκεκριμένα το μάτισμα των πρωτεϊνών. Μία από τις σημαντικότερες διαδικασίες ρύθμισης της γονιδιακής έκφρασης αποτελεί η παραγωγή ποικίλων προϊόντων ματίσματος. H διατριβή αυτή είχε ως στόχο να αναδείξει τη σημασία της επιλογής των θέσεων που έχουν λειτουργική σημασία για την έκφραση του γονιδίου, και συγκεκριμένα τη ρύθμιση του ματίσματός
more » ... ου. Επιλέγοντας ως πρότυπο νόσημα τον «πολυπαραγοντικό» διαβήτη τύπου 2, εντοπίσαμε «σημαντικά» για τη νόσο γονίδια και προσδιορίσαμε με τη χρήση εργαλείων βιοπληροφορικής, που αναφέρονται σε παραμέτρους της λειτουργικής γονιδιωματικής ένα μικρό αριθμό πολυμορφισμών, που βρίσκονται σε ρυθμιστικές για το μάτισμα θέσεις (εξονικές αλληλουχίες ματίσματος), μεταβάλλουν το δυνητικό επιγενετικό προφίλ του DNA (απαλοιφή/δημιουργία αλληλουχιών CpG) και τελικά σχετίζονται με προδιάθεση για τη νόσο. Οι πολυμορφισμοί που μελετήσαμε ήταν συνώνυμοι, διότι είναι αυτοί που διαφεύγουν τον έλεγχο και θεωρούνται ουδέτεροι. Από το σύνολο των 670 εξονικών πολυμορφισμών 232 (35%) ήταν συνώνυμοι. Η πολυμορφικότητα των γονιδίων που σχετίζονται με τη νόσο ήταν περιορισμένη στις σημαντικές για το μάτισμα θέσεις και στα εναλλακτικά ματιζόμενα εξόνια (10% των συνώνυμων εξονικών πολυμορφισμών βρίσκονταν σε εξονικούς ενισχυτές ματίσματος και εναλλακτικά ματιζόμενα εξόνια). Το γεγονός αυτό σημαίνει την ύπαρξη αυστηρών κανόνων επιτήρησης του ματίσματος σε γονίδια που σχετίζονται με τη διαδικασία διακίνησης της γλυκόζης. Εντούτοις, ιδιαίτερα υψηλή εμφανίζεται η πολυμορφικότητα των θέσεων μεθυλίωσης - θέσεις CpG στις ρυθμιστικές για το μάτισμα ακολουθίες (56% των συνώνυμων πολυμορφισμών που επηρεάζουν σημαντικά το μάτισμα βρίσκονται σε θέσεις CpG). Αυτό υποδηλώνει την ιδιαίτερη βαρύτητα που μπορεί να έχουν οι πολυμορφισμοί σε θέσεις CpG στη διαδικασία του ματίσματος. Από την αξιολόγηση των συνώνυμων εξονικών πολυμορφισμών σε ρυθμιστικές για το μάτισμα θέσε [...]
doi:10.26262/heal.auth.ir.136005 fatcat:hmipvlwul5cjtpx6iw5yxxb3pq