Remerciements Après trois années bien remplies et de nombreuses heures passées à rédiger, il est maintenant temps de mettre un point final à ce manuscrit de thèse. Pour cela, je tiens à remercier toutes les personnes impliquées de près ou de loin dans ces travaux, ainsi que toutes celles qui ont rempli ces années de moments si agréables. Je tiens tout d'abord à remercier chaleureusement mes directeurs de thèse, Laury Gauthier et Eric Pinelli, grâce à qui ces années de thèse ont été très riches

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... cientifiquement et humainement parlant. Nos longues discussions autour d'un café ou au détour d'un couloir ont été très enrichissantes pour moi. Cela a été un réel plaisir de travailler avec vous et de « débroussailler » ensemble cette thématique nano/méso. Vous vous êtes tous les deux montrés disponibles, plein de bons conseils et de bonnes idées, attentifs et drôles. Merci d'avoir été présents à chaque fois que j'en ai eu besoin, pour discuter du projet, des résultats, de la rédaction, et de tout le reste. Mes remerciements chaleureux vont également à Florence Mouchet, qui s'est énormément investie dans cette thèse et a été présente sur tous les fronts. C'est avec toi que j'ai appris à gérer au quotidien tous les aspects du métier de chercheur (ou une grande partie du moins). C'est un bonheur de travailler avec quelqu'un d'aussi dynamique, réactif et efficace que toi ; d'aussi patient, attentif et attentionné. Tu as plus d'une fois débloqué des situations compliquées et fait avancer les choses pour qu'on puisse travailler dans les meilleures conditions, et tu as également toujours été présente, dans les bons moments comme dans les plus difficiles. Eric, Laury, Florence, ça a été une vraie chance pour moi de faire mes débuts dans la recherche avec vous. J'ai particulièrement apprécié nos réunions interminables, où la bonne humeur était autant au rendez-vous que la science. Si j'ai parfois désespéré d'arriver à vous mettre d'accord, c'est finalement grâce à vos points de vue différents et complémentaires que ce projet a si bien avancé et que j'ai pu progresser comme je l'ai fait. Vous faites un trio de choc, aux qualités scientifiques et humaines certaines. Un grand merci donc pour votre disponibilité, vos conseils, votre soutien, votre gentillesse et votre bonne humeur, qui ont été essentiels pour moi tout au long de cette thèse. Merci pour cette belle aventure ! Je souhaite par la suite remercier les autres membres du jury : Jérôme Rose et Bernard Clément pour avoir accepté d'être rapporteurs de mes travaux de thèse ; Laure Giamberini, Présidente de ce jury, ainsi que Jean-Pierre Gagné, pour avoir évalué ces travaux. Je remercie également Jean-Marc Bonzom d'avoir accepté de participer à ce jury. Je tiens à remercier chacun de vous pour vos remarques pertinentes et constructives, et pour m'avoir permis de profiter de ces échanges intéressants jusqu'à la dernière minute. Je souhaite également remercier chaleureusement trois autres personnes qui ont contribué de près au projet MESONNET, et avec qui j'ai eu grand plaisir à travailler. Tout d'abord, Jérôme Silvestre, notre MacGyver local. Vous avez réussi à résoudre tous les problèmes techniques qu'on a pu rencontrer (c'est dire !) et avec vous il y a toujours une solution à tout. Un grand merci Jérôme pour avoir été si disponible, et toujours avec beaucoup de patience, de gentillesse et de bonne humeur. Un grand merci aussi à Laurent Verneuil, mon co-bureau, mon binôme, mon pote... on a commencé la thèse en même temps et fini en même temps, à 24h près... si c'est pas beau ça ! Trois ans dans le même bureau et on ne s'est pas entre-tués (on a même échappé à la mort par asphyxie !) ! Merci Lolo d'avoir été là pendant ces trois années (ça a notamment été plus facile de traverser toutes les galères de la fin de thèse ensemble), merci pour tous les coups de main pour le boulot et tous les moments moins studieux passés à papoter et boire des cafés. Et enfin, un grand merci à Stéphanie Cadarsi qui m'a épaulée (et supportée !) du début à la fin de ma thèse, et qui a été aussi efficace qu'adorable. Merci pour ta bonne humeur et ta patience Steph. A l'occasion il faudra qu'on pense à aller planter les carottes, pour voir si elles poussent... Je tiens aussi à remercier tout particulièrement Franck Gilbert, toujours prêt à prêter main forte pour les mésocosmes, et qui ne se déplace jamais sans sa bonne humeur, ses blagues et son appareil photo ! Merci d'avoir immortalisé ces moments mémorables ! J'ai aussi eu la chance de m'initier avec vous à l'étude de la bioturbation, même si hélas le temps nous a manqué pour exploiter ces manips jusqu'au bout. Je remercie également vivement Jean-Marc Bonzom pour tous nos échanges, et dont les conseils avisés sur les mésocosmes ont été essentiels. Merci également de m'avoir accueillie dans votre laboratoire pour tout m'apprendre sur la dentition des chironomes ! Je souhaite aussi remercier Eric Chauvet pour son aide précieuse concernant l'étude de la décomposition de la litière et des hyphomycètes. Merci également à Sylvain Lamothe pour toutes les analyses effectuées sur ces échantillons. Je tiens également à exprimer ma reconnaissance à l'Agence Nationale de la Recherche (ANR) et au GDRi iCEINT pour leur soutien financier. J'adresse également mes remerciements à Jean-Yves Bottero, directeur du GDRi iCEINT et coordinateur du projet ANR MESONNET, dans le cadre duquel a été effectuée cette thèse. Travailler dans le cadre d'un programme ANR et d'un GDRi m'a notamment permis de découvrir d'autres horizons et de rencontrer d'autres personnes, que je souhaite remercier ici. Je remercie en premier lieu l'équipe du CEREGE, pour tous les échanges que nous avons eus et pour m'avoir accueillie durant trois semaines. Je remercie ainsi Jean-Yves Bottero et Mélanie Auffan pour leur accueil. Merci également à Marie Tella qui m'a encadrée lors des manips et qui a patiemment répondu à toutes mes questions. Je remercie aussi Perrine Chaurand pour les analyses effectuées en microtomographie. Merci pour ta persévérance malgré les coupures de courant régulières. Merci également à Jérôme Rose et Clément Levard pour les échanges que nous avons eus à cette occasion, et à d'autres moments durant ces trois dernières années. Je souhaite également adresser un grand merci à Sophie et sa coloc Camille pour m'avoir accueillie chez elles pendant cette période. Merci aussi aux copains, Lise & Nico, Julien, Julie, Etienne et Jade. Vous m'avez fait me sentir chez moi pendant tout ce temps, vous avez été super ! Partons maintenant un petit peu plus au nord... Je remercie ici l'équipe du LIEC : merci à Laure Giamberini et Christophe Pagnout pour nos échanges et vos conseils, ils m'ont aidée à faire avancer le projet et guidée dans ma réflexion. Merci aussi Christophe pour les analyses bactério. Merci également à Simon Devin pour son travail sur la « matrice toulousaine » et ses explications sur ces analyses complexes. Une pensée enfin pour Maël Garaud avec qui j'ai bien rigolé à Duke ; bon courage pour la fin de ta thèse. Pour finir, partons beaucoup plus loin cette fois-ci : je tiens à remercier Mark Wiesner, de l'Université de Duke (USA) et directeur du CEINT, pour son accueil chaleureux lors de mes déplacements à Duke. Je souhaite également remercier Benjamin Espinasse de m'avoir accueillie chez lui lors de mon premier séjour à Duke, et de m'avoir guidée entre le campus, le site des mésocosmes et la ville. Merci également d'avoir installé tout le système de sondes et d'enregistrement des données lors de ton passage à Toulouse. Revenons maintenant aux Toulousains. Je souhaite remercier toutes les personnes qui m'ont permis d'avancer dans mes travaux, directement ou indirectement. Tout d'abord, une mention spéciale pour Annick Corrège, à qui on peut faire confiance pour régler rapidement tous les problèmes divers et variés, et qui est toujours prête à rendre service avec le sourire. Un grand merci pour ton soutien durant cette fin de thèse, merci de m'avoir écoutée, motivée, fait rigoler. J'admire ta capacité à faire avancer le travail malgré les litres de café qu'on t'a fait boire Laurent et moi, et malgré les heures passées à essayer de te distraire... Je tiens à remercier David Baqué pour les analyses effectuées en ICP-OES/MS. Merci pour tes explications et tes coups de main lors des analyses et pour le « dépouillement » des données. Merci également à Marie-Josée Tavella et Virginie Suc pour leur disponibilité et leur gentillesse. Merci à Annie Perrault pour son support technique. Je souhaite remercier le Service Commun de Microscopie (TEMSCAN), et notamment Lucien Datas pour ses grandes compétences en MET. Je remercie également le Centre de Microscopie Electronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), et en particulier Isabelle Fourquaux pour la préparation des nombreuses coupes d'organes. Mes remerciements vont également à Georges Merlina pour ses conseils avisés de chimiste tout au long de ma thèse, et à Maialen Barret pour avoir aussi éclairci certains points en microbiologie. Je remercie de manière générale toutes les personnes que je n'ai pas citées mais avec qui j'ai eu l'occasion d'interagir durant ma thèse, pour leurs conseils, remarques, encouragements et bonne humeur. Je tiens enfin à remercier les personnes qu'on voit rarement dans les labos mais sans qui tout ce travail ne serait pas possible. Je pense tout d'abord à Yannick Combarieu (pour avoir évité plus d'une fois les pétages de plombs, au sens propre comme au figuré), René Nouilhan (pour les « boîtes à moustiques ») et Jean-Marie Arpizou. Un grand merci également à Cécile Odorico pour avoir géré en temps record nos commandes, toutes plus urgentes les unes que les autres. J'ai enfin une pensée amicale pour Paule Tabarelli, pour la réception de montagnes de colis. Je remercie également chaleureusement les doctorants, post-doctorants, stagiaires et les autres pour les moments passés ensemble : Allison pour son amitié, toutes nos soirées et les heuuuures passées à discuter (Allez ma belle, t'es presque au bout, courage !) ; Marion, avec qui j'ai adoré partager mon bureau ; Antoine, qui lui a succédé au bureau mais qui a dû partir trop vite en exil à l'étage (pas grave, on a bien rigolé quand même !) ; 'équipe des « Etoiles Brillent Pour Tous » (merci notamment à Thierry et Pieter). J'ai enfin une petite pensée pour Laura qui reprend tout juste le flambeau : bon courage pour tout ce qui t'attend et je te souhaite de te régaler autant que moi ! Un remerciement spécial à mes amies de longue date qui m'ont soutenue et ont été à mes côté en toute occasion. Un grand merci à Sophie, encore une fois pour m'avoir hébergée à chacun de mes passages à Aix et pour m'avoir vraiment fait me sentir chez moi quand j'étais loin des miens. Merci aussi pour avoir assuré à 200% dans les moments les plus durs. Maintenant c'est toi qui attaque la dernière ligne droite... plein de courage ma vieille ! Un autre grand merci à Julie, alias Tuctuc. C'est bon de pouvoir compter sur toi, pour tout, tout le temps ! Tes fou-rires aux narines frémissantes me manquent déjà ! Et un grand merci encore à Manue pour tous ces bons moments passés ensemble avant que tu ne t'exiles au fin fond du Lot... promis même là je viendrai t'embêter ! Et un dernier grand merci à Barbara, toujours partante pour profiter de la vie ! J'adore autant nos longues discussions sur toutes les choses de la vie que ton grain de folie en soirée, t'es géniale ! Pour conclure ces remerciements, je tiens évidemment à remercier du fond du coeur ma famille, qui a toujours été à mes côtés, m'a soutenue et m'a portée jusque-là. Je vous dois beaucoup. Finalement, je pense que ça va me manquer de ne plus entendre : « Alors, elles vont comment tes grenouilles ? » ! Merci pour tout !