TICK-BORNE RICKETTSIOSIS CASED BY RICKETTSIA HEILONGJIANGENSIS, AND ITS LABORATORY DIAGNOSTICS IN THE ALTAI REPUBLIC
КЛЕЩЕВОЙ РИККЕТСИОЗ, ВЫЗЫВАЕМЫЙ RICKETTSIA HEILONGJIANGENSIS, И ЕГО ЛАБОРАТОРНАЯ ДИАГНОСТИКА В РЕСПУБЛИКЕ АЛТАЙ

L.D. Schuchinova, E.I. Bondarenko, A.V. Echesheva, A.N. Shvalov, V.I. Zlobin
2020 Современные проблемы науки и образования (Modern Problems of Science and Education)  
Целями исследования являлись изучение клинических и эпидемиологических особенностей клещевого риккетсиоза, вызываемого Rickettsia heilongjiangensis, выявленного в Республике Алтай, и оценка эффективности нового метода его лабораторной диагностики. Для выявления больных клещевым риккетсиозом в сезонах 2015-2019 гг. применяли ПЦР-исследование смывов, забранных у пациентов с места присасывания клеща, с последующим секвенированием нуклеиновых кислот. Всего был исследован 241 образец смывов,
more » ... зец смывов, забранных у лиц, госпитализированных в медицинские организации Республики Алтай с диагнозом «сибирский клещевой тиф» (СКТ). Исследование проводилось с помощью ПЦР-теста «РеалБест ДНК Rickettsia sibirica/Rickettsia heilongjiangensis». Смывы забирались в день поступления пациентов в стационар с первичного аффекта (с зоны некроза в месте присасывания клеща). В 17 пробах (7,1%) была обнаружена ДНК R. heilongjiangensis, эти образцы были секвенированы по областям трех генов: gltA, ompB и sca4. Полученные нуклеотидные последовательности были полностью идентичны друг другу для каждого из трех анализируемых генов. Частичные последовательности генов gltA, ompB и sca4 для изолята от пациента были депонированы в GenBank: изолят R. heilongjiangensis Горно-Алтайск-2017 (MN537884, MN537885, MN537886). Показана эффективность нового метода лабораторной диагностики клещевых риккетсиозов и выявлены клинические особенности клещевого риккетсиоза, вызываемого R. heilongjiangensis, распространенного в предгорной части Республики Алтай. Ввиду того что подобные случаи ранее диагностировались как случаи сибирского клещевого тифа, описанный метод рекомендуется использовать для дифференциальной диагностики двух распространенных клещевых риккетсиозов -вызываемых Rickettsia sibirica и Rickettsia heilongjiangensis. Ключевые слова: клещевой риккетсиоз, Rickettsia heilongjiangensis, иксодовые клещи, смывы с первичного аффекта, ПЦР, Республика Алтай. The purpose of the research was to study the clinical and epidemiological characteristics of tick-borne rickettsiosis caused by Rickettsia heilongjiangensis identified in the Altai Republic, and evaluate the effectiveness of a new method for its laboratory diagnosis. In order to identify patients with tick-borne rickettsiosis in the seasons of 2015-2019, a PCR study of swabs taken from patients from the site of tick suction with subsequent nucleic acid sequencing was used. In summary, 241 samples of eschar swabbing from the patients hospitalized in the medical organizations of the Altai Republic with an initial diagnosis of "Siberian tick-borne typhus". The study was carried out using the PCR test "RealBest DNA Rickettsia sibirica/Rickettsia heilongjiangensis". R. heilongjiangensis DNA was detected in 17 tests (7,1%). Swab samples containing R. heilongjiangensis DNA were sequenced over the regions of three genes: gltA, ompB, and sca4. The obtained nucleotide sequences were completely identical to each other for each of the three analyzed genes. Partial sequences of the gltA, ompB, and sca4 genes for the isolate from the patient were deposited in GenBank: R. heilongjiangensis isolate Gorno-
doi:10.17513/spno.30078 fatcat:ikmbkziuhvhdxn5w52ul7su7ti