Recherche d'Information Multi Terminologique au sein d'un Dossier Patient Informatisé

Philippe Président, Thierry, Lecroq Rapporteurs, Anita Burgun, Marie-Christine Jaulent, Marc Cuggia, Lina Soualmia, Guillaume Savoye, Jean-Philippe Leroy
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Á mes parents Á toute ma famille Á Hibo REMERCIEMENTS Au terme de ce doctorat, je tiens tout d'abord à remercier mon DIEU le tout Puissant, tout simplement pour m'avoir offert cette vie et cette opportunité. Je souhaiterais, en premier lieu, exprimer ma profonde reconnaissance à Monsieur Stéfan Jacques Darmoni, qui a été, pour moi un très bon directeur de thèse. Je le remercie tout particulièrement de la confiance qu'il m'a témoignée, sa grande disponibilité et sa bonne humeur durant la réunion
more » ... hebdomadaire de l'équipe. Je tiens à remercier tout particulièrement, et à témoigner ma reconnaissance à Monsieur Philippe Massari, pour nos nombreuses discussions tant scientifiques que médicales, sa disponibilité tout au long de ce travail ; je le remercie également pour sa relecture constructive et approfondie de mon mémoire. Je remercie Madame Marie-Christine Jaulent et Madame Anita Burgun qui ont accepté d'être mes rapporteurs et qui ont évalué mon travail. Je tiens à remercier trés sincèrement l'ensemble des membres du jury (Thierry Lecroq, Marc Cuggia, Lina F. Soualmia, Guillaume Savoye, Jean-Philippe Leroy,) qui me font le grand honneur d'avoir accepté de juger mon travail. Je dédie cette thèse à mes parents, les mots me manquent et je ne pourrais résumer en quelques lignes toute ma reconnaissance pour eux. Je les remercie tendrement ainsi que ma famille (Fathiya, Ayane, Doubad, Kadidja, Fatouma, Bachir et Moustapha) pour leur soutien constant durant cette période... Je ne manquerais au passage de remercier un exceptionnelle personne avec un fort tempérament qui a toujours été à côté de moi. Il m'est impossible d'oublier de remercier nos institutions djiboutiennes à travers l'université de Djibouti et l'actuel président Monsieur Djama Moohamed Hassan ainsi que iii iv son prédécesseur Monsieur Abdillahi Omar Bouh, qui soutiennnent inlassablement les enseignants dans leurs voeux d'entamer une carrière dans la recherche. Je remercie le laboratoire LITIS EA 4108 de m'avoir accueilli en son sein et de m'avoir offert d'excellentes conditions de recherche. J'adresse tout particulièrement un grand merci chaleureux à tous les membres de l'équipe CISMeF (Badisse, Benoit, Catherine, Gaétan, Ivan, Romain, Sandrine, Tayeb) les cismefisés (Lina, Pereira, Josette), tous les docteurs qui m'ont précédé et même "dépassé", les doctorants (Zeid, Weim, Nicolas, Julien, Adila), leur souhaitant un très bon marathon... et sans oublier l'équipe TIBS. Je tiens à remercier Christian Kala-Lobé pour son assistance lors de la mise en place des outils sémantiques d'Oracle. Pour reprendre un ordre plus chronologique, je souhaite évidemment remercier mes amis de longue date, Mohamed Kileh Wais, pour sa disponibilité et en lui souhaitant une bonne fin de thèse, Ilyass Souleiman, Abdirahman M. Ahmed, Said Dabar Ouffaneh qui ont su me donner le courage et l'énergie de me relever à tout moment pour finir cette thèse marathon. Mes plus vifs remerciements à mon ancien directeur, Mohamed Hassan Doualeh pour son esprit ouvert et pour m'avoir permis d'évoluer dans ma vie professionnelle et de m'orienter dans ce domaine de recherche. Une spéciale dédicace aux membres du G6, Fatya, Hala, Samira, Chouaibe, Fanan (et A3D). Merci pour votre amitié et pour tous les moments de détente et fous rires inoubliables passés ensemble. Enfin merci à toutes les personnes que je n'ai pas citées ici et qui se reconnaîtront dans ces quelques lignes. Bien entendu, ce travail ne serait pas ce qu'il est devenu sans les discussions avec les chercheurs qui ont croisé mon chemin au cours des différentes rencontres scientifiques, sans leurs écrits qui ont été pour moi autant de chemins de lecture et qui ont apporté une base à cet édifice. Mots -clés : Dossier médical informatisé, Recherche et stockage d'information, Système d'Information, Web Sémantique, Modélisation de données. v ABSTRACT Recent technological advances have led to new opportunities for the access and processing of data in medicine. The Electronic Health Record (EHR), in this context, is considered to be a basic tool for building a Clinical Decision Support System (CDSS). The use of medical data and the access to concise information have become of major importance for clinicians. Numerous medical terminologies have been developed to meet different purposes : ICD-10 and CCAM classifications for epidemiologic, medicoeconomic coding, SNOMED nomenclature for clinical coding, ATC classification for drug prescriptions coding, and finally LOINC nomenclature for biological coding analysis. However, the fact is : that there is an increasing of amount of data, which has become more complex with difficult access. Also much of the information is poorly structured and mainly in a text format, including an information overload. Subsequently, as there is a growing need to perform information retrieval (IR) of medical data, it will be necessary to include in EHRs, in addition to their management and communication functions, as well as IR functions. This requires the development of IR tools close to existing Web IR tools. The IR tools oriented by EHR are based on information model [data] for IR, and independent from EHR management system models. The aim of our research was to mainly develop a generic data model adapted to IR. This model, based on information elements concept of EHR, is designed in a hybrid approach (Entity-Relationship approach, metadata approach) for a multi-level model in order to achieve an interoperability, not only on the data level but also on the semantic level, and to combine a level of granularity for better scalability. Based on our research, we were able to develop a RIDoPI prototype using a proof of concept with Semantic Web technologies.
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