R3CリガーゼリボザイムのKissing-Loopを介した反応メカニズム解析とRNA進化モデル

Hamachi Kokoro
2-5. Kissing-Loop の欠損(1 nt)変異体の作製/活性定量 2-6. Kissing-Loop の欠損(2 nt)変異体の作製/活性定量 2-7. Kissing-Loop のもつ安定化エネルギーの定量化 2-8. Kissing-Loop のもつ自由エネルギー効果と触媒活性の相関分析 2-9. Kissing-Loop をトリガーとしたリボザイムの機能発現メカニズム仮説 2-10. +の融合変異体の作製/活性定量 2-11. 変異体を用いた Tm 値の計測 2-12. 変異体を用いた作用メカニズム検証における成果 2-13. 自由エネルギーから考える+の二量体化形成 2-14. リガーゼリボザイムの in vivo 環境における機能発現の可能性 2-15. 速度論の観点でのリボザイム 2 分子反応の洞察 2-16. 熱力学的な安定性とリボザイム活性の相関への考察 3 章. Kissing-Loop 相互作用をトリガーとした短鎖 RNA の機能獲得モデルの構築 ......32 3-1. 研究の目的 3-2. tRNA の有する保存領域と先行研究 3-3. tRNA
more » ... の進化モデルの構築 3-4. Kissing-Loop による長鎖化と機能獲得仮説の検証 3-5. 変異体の作製 3-6. mini-G3/U70 の Kissing-Loop 相互作用をトリガーとした二量体化の検証 3 / 71 3-7. mini-G3/U70 二量体のアミノアシル化能の検証 3-8. ミニヘリックス Ala と tRNA Ala のアミノアシル化能の比較 3-9. FRET を用いた mini-G3/U70 のモノマー時コンフォメーションの確認 3-10. エネルギー転移効率の理論値概算 3-11. mini-G3/U70 の二量体の形成割合算出 3-12. 短鎖 RNA の機能獲得モデル構築の成果 3-13. 自由エネルギーから考える mini-G3/U70 の二量体化の割合 3-14. 考察 4 章. 総合考察 .............................................................................................50 4-1. 本研究の成果と意義 4-2. RNA 間相互作用の豊富なバリエーション 4-3. リボスイッチにおけるステムループのコンフォメーション変化の重要性 4-4. RNA2分子モデルの核酸医薬設計への応用の可能性 4-5. RNA ウイルスへの本成果の応用の可能性
doi:10.20604/00003605 fatcat:u65jxr6cvjf27cmj6g5cnjpwjq