Dalam ilmu Biologi, terdapat berbagai cara untuk menentukan kedekatan antar dua individu, antara lain dengan mengamati kesamaan morfologi fisik kemudian membuat dendogram dan pembuatan pohon filogeni untuk menelusur kekerabatan berdasarkan sejarah evolusi suatu makhluk hidup. Akan tetapi pendekatan ini sangat sulit untuk dilakukan apabila hewan yang akan ditentukan kekerabatannya tidak berada dalam kondisi yang hidup, sehingga sangat sulit untuk mengamati ciri-ciri fisik yang ada. Penelitian

more »

... bertujuan untuk memberikan pendekatan yang berbeda dalam menentukan kekerabatan hewan dengan menggunakan algoritma clustering untuk mengelompokkan struktur protein IGF2. Kekerabatan dilakukan dengan menggunakan metode clustering K-Means. Untuk memudahkan dalam melakukan pengelompokkan struktur protein yang memiliki panjang sekuens yang beragam, maka teknik n-gram digunakan untuk memecah string menjadi beberapa subsekuens dengan panjang yang sama. Pengelompokkan dengan metode K-Means telah dilakukan dan mendapatkan hasil terbaik pada jumlah cluster sebanyak tujuh cluster, dengan silhouette coeficient rata-rata sebesar 0.331, indeks puritysebesar 0.735, dan precisionsebesar 0.823 yang mengindikasikan proses clustering cukup efektif.