Virulence Factors and Phylogenetic Characteristics of Uropathogenic Eschericihia coli Strains Isolated in Saratov
A. V. Kazantsev, N. A. Osina, T. O. Glinskaya, O. N. Kosheleva, Yu. V. Maksimov, Z. L. Devdariani, A. N. Mikerov
2020
Problems of Particularly Dangerous Infections
фаКторЫ вирулентноСти и филогенетичеСКая хараКтериСтиКа уроПатогеннЫх штаммов eschericihia coli, вЫделеннЫх на территории г. Саратова 1 ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов, Российская Федерация; 2 ФГБОУ ВО «Саратовский государственный медицинский университет им. В.И. Разумовского» Министерства здравоохранения Российской Федерации, Саратов, Российская Федерация; 3 ГУЗ «Саратовская городская клиническая больница № 8», Саратов, Российская Федерация
more »
... ь. молекулярно-генетическая характеристика штаммов уропатогенных Escherichia coli, выделенных из мочи пациентов с инфекциями мочевыводящих путей на территории саратова, с целью определения принадлежности к филогенетическим группам и подгруппам и выявления генетических маркеров, ассоциированных с вирулентностью. материалы и методы. исследовано 102 штамма уропатогенных E. coli, выделенных из мочи пациентов с инфекциями мочевыводящих путей. методом пцр определяли частоту встречаемости генов (fimH, pap, sfa, afa, iha, irp2, iuc, iroN, hlyA, vat, usp, kpsMT, iss, cva, ompT), ассоциированных с факторами адгезии, утилизации железа, токсигенности, устойчивости к действию сыворотки (комплемента) и персистенции, а также принадлежность к конкретным филогенетическим группам и подгруппам (путем амплификации генов chuA, yjaA и TspE4.C2). результаты и обсуждениe. установлено, что исследованные штаммы E. coli принадлежали к различным филогенетическим группам и подгруппам (A 1 , B1, B2 3 , D 1 и D 2 ) и различались набором генов, кодирующих основные факторы вирулентности. при этом частота выявления уропатогенных E. coli, относящихся к подгруппе B2 3 , оказалась превалирующей. более того, штаммы данной филогенетической подгруппы отличались наибольшим набором генов, кодирующих факторы вирулентности возбудителя. у всех изученных штаммов уропатогенных E. coli, принадлежащих к различным филогенетическим группам и подгруппам, выявлено наличие генов, ответственных за синтез сидерофоров (irp2, iuc, iroN), устойчивости и персистенции (ompT) и факторов адгезии (fimH, iha). таким образом, штаммы уропатогенных E. coli, выделенные от пациентов с инфекциями мочевыводящих путей в саратове, принадлежат к различным филогенетическим группам и подгруппам и обладают различным набором генетических маркеров вирулентности, что может оказывать влияние на степень патогенности возбудителя и отражаться на тяжести течения и длительности заболевания. Ключевые слова: уропатогенные Escherichia coli, факторы вирулентности, филогенетическая характеристика.
doi:10.21055/0370-1069-2019-4-56-60
fatcat:f3ru6ofqhzey7oeiwwem3xa2xu