Kinetic study of the linear ising chain. comparison with ultrasonic absorption measurements in solutions of polypeptides

Y. Dormoy, R. Cerf
1976 Journal de Physique Lettres  
2014 La cinétique de la chaîne linéaire d'Ising a été traitée sans autre approximation que la fermeture aux triplets et la réduction à quatre des équations cinétiques. On a étudié plus particulièrement l'influence des fluctuations du nombre de séquences ininterrompues d'éléments identiques en introduisant une variation de volume molaire 0394V liée à ces fluctuations. Par un choix adéquat des paramètres cinétiques, il est possible de prendre en compte au moins partiellement des interactions à
more » ... gue distance et des effets de bouts de chaine. La théorie est appliquée à l'étude cinétique de la transition hélice-pelote des polypeptides. Pour une chaîne relativement courte d'acide poly-1-glutamique de masse moléculaire M = 12 000, qui est encore longue devant la distance de coopérativité, le déplacement du pic d'absorption ultrasonore dû à la relaxation 1 vers les hélicités élevées va de pair avec l'apparition d'une contribution non négligeable de l'absorption due à une seconde relaxation. Les résultats de la théorie sont en accord avec les mesures existantes, et l'on a pu évaluer le volume A V. Abstract. 2014 A study of the kinetics of the linear Ising chain has been carried out using as sole approximations the triplet closure and four kinetic equations. In particular, we have examined the effect of fluctuations of the number of uninterrupted sequences of the like elements by introducing a molar volume change 0394V associated with these fluctuations. Long range interactions and end effects can be partially accounted for by a suitable choice of the kinetic parameters. The theory is applied to the kinetic study of the helix-coil transition of polypeptides. For a relatively short poly-1-glutamic acid chain of molecular weight M = 12 000 (which is still long compared with the cooperativity length) the shift of the ultrasonic absorption peak due to relaxation 1 is accompanied by a nonnegligible contribution of the absorption associated with a second relaxation. The theoretical results agree with existing measurements, and we have evaluated the volume 0394 V.
doi:10.1051/jphyslet:019760037010026500 fatcat:7sjqxdrcenblpgdjvqrnbtin2q