Evaluation and testing of fungal cluster border prediction based on computational molecular evolution (FunOrder) program

Denise Schaffer, Robert Mach, Christian Derntl
2021
FunOrder (Fungal cluster border prediction based on computational molecular co-evolution) ist ein Genome Mining Programm, welches die evolutionäre Verbindung zwischen Genen und Gencluster aus Pilzen untersucht. Während des Projekts sollte das Programm durch die manuelle Auswertung phylogenetischer Bäume von Genen aus experimentell ermittelten pilzlichen biosynthetischen Gencluster (BGC) als Positiv- und aus zufällig generierten Cluster als Negativkontrollen evaluiert werden. Die daraus
more » ... Daten wurden anschließend verwendet, um die koevolutionären Grenzen von Proteinfamilien in Gencluster von Pilzen zu definieren. Ziel des Projektes war die Untersuchung und Verifikation, ob FunOrder korrekte Clustergrenzen in Pilzen vorhersagen kann und damit als neues Tool zur Entdeckung von neuen Sekundärmetaboliten geeignet ist.
doi:10.34726/hss.2021.72480 fatcat:oc7i3ss27rannb2est4msial4e