Senyawa Alami Bawang Putih Tunggal sebagai Inhibitor LpxC Bakteri Pseudomonas aeruginosa melalui Virtual Screening

Nur Fitriana, Sri Rahayu Lestari, Betty Lukiati
2018 Mutiara Medika  
Abstrak: Pseudomonas aeruginosa merupakan salah satu bakteri Gram negatif penyebab infeksi nosokomial yang memiliki resistensi tinggi terhadap berbagai antibiotik karena adanya lipid A, komponen LPS bersifat toksik pada inang. Sintesis lipid A dimulai dari Kdo 2 -lipid A, difasilitasi oleh enzim LpxC. Enzim LpxC merupakan target pengembangan antibiotik karena adanya kofaktor Zn 2+ . Bawang putih tunggal merupakan herbal potensial pengganti antibiotik sintetis. Alliin, Allicin dan Ajoene yang
more » ... dan Ajoene yang terkandung dalam bawang putih tunggal memiliki aktivitas antibakteri. Penelitian ini bertujuan memprediksi potensi senyawa organosulfur bawang putih tunggal sebagai agen antibakteri melalui virtual screening menggunakan metode molecular docking. Metode yang dilakukan adalah memprediksi potensi senyawa organosulfur menggunakan web server PASS dan melakukan docking untuk mengetahui interaksi ligan-protein target. Hasil penelitian menunjukkan, senyawa organosulfur berpotensi sebagai antibakteri, antibiotik, dan immunomodulator. Aktivitas antibakteri terbaik ditunjukkan oleh senyawa Alliin dengan nilai afinitas pengikatan -5,2 kkal/mol. Semua senyawa organosulfur memiliki sisi aktif yang sama dengan kontrol (Ciprofloxacin dan Imipenem) pada enzim LpxC. Sisi aktif ditunjukkan dengan adanya residu asam amino (Ser295, Val182, dan Tyr 296) yang berikatan dengan ikatan hidrogen dan interaksi hidrofobik (Phe152, Phe181, Gly85, Phe176, Ala84, Val182, Ser180, Ile241, Leu86, Tyr296, Ser295 dan Met297) antara ligan-protein target. 2+ . Single bulb garlic is potential herbal successor synthetic antibiotics. Alliin, Allicin, and Ajoene are contained in a single bulb garlic have antibacterial activity. This research aims predict potential of an organosulfur compounds single bulb garlic as antibacterial agents through a virtual screening method using molecular docking. Method does is to predict potential organosulfur compounds using web servers PASS and the docking ligand-interactions to figure out the target protein. The results showed, organosulfur compounds are potent antibacterial, antibiotic, and immunomodulator. Antibacterial activity of Alliin compound is shown by the best-value binding affinity-5.2 kcal/mol. Organosulfur compounds all have the same Active side controls (Ciprofloxacin and Imipenem) on LpxC enzyme. The active side is shown by the Abstract: Pseudomonas aeruginosa is one of gram-negative bacteria causes nosocomial infection that have high resistance against various antibiotics due to lipid A, LPS are toxic components on the host. Lipid A synthesis starting from Kdo 2 -lipid A, facilitated by the LpxC enzyme. LpxC enzyme is the target development of antibiotics due to cofactors Zn
doi:10.18196/mm.180111 fatcat:c5vvwajrzrb3vaeyle42q3pxbq