Quantification of genetic diversity at allozyme loci

E.E. Berg, J.L. Hamrick
1997 Canadian Journal of Forest Research  
Starch gel electrophoresis provides a powerful and cost-effective assay of genetic variation in plant populations and species. Allozyme loci are typically single-gene traits that assort independently and are codominant. Sample sizes of 30-50 individuals surveyed at 10-20 polymorphic loci will adequately characterize the genetic diversity in a population and indicate how genetic diversity is partitioned among populations. Parameters that should be reported are the percentage of polymorphic loci
more » ... P), mean number of alleles per polymorphic loci (AP), expected heterozygosity (genetic diversity, H e ), Nei's G ST , genetic identity (I), and genetic distance (D). Examples are provided, and statistical tests of parameter estimates are summarized. Résumé : L'électrophorèse sur gel d'amidon constitue une méthode puissante et économiquement abordable pour estimer la variabilité génétique des espèces végétales et de leurs populations. Les loci d'alloenzymes représentent des caractères typiquement monogéniques, qui se recombinent de façon indépendante et affichent des allèles co-dominants. Des tailles d'échantillon variant de 30-50 individus analysés pour 10-20 loci polymorphes s'avèrent suffisantes pour caractériser de façon adéquate la diversité génétique d'une population et évaluer comment la diversité génétique se répartit parmi les populations. Les paramètres qui devraient être utilisés sont le pourcentage de loci polymorphes (P), le nombre moyen d'allèles par locus polymorphe (AP), l'hétérozygotie théorique (diversité génétique, H e ), la valeur G ST de Nei, l'identité génétique (I) et la distance génétique (D). Les auteurs présentent des exemples, en plus de faire un sommaire des tests qui permettent d'évaluer la confiance statistique des estimations de paramètres. [Traduit par la Rédaction]
doi:10.1139/cjfr-27-3-415 fatcat:xwmq4abq6fg3rkfau6452nwthi