EVALUATION OF THE EFFICIENCY OF SAMPLING AND PRESERVING METHODS FOR NON-INVASIVE SAMPLES WHEN BROWN BEAR POPULATION-GENETIC STUDIES ARE CONDUCTING

Анастасия Сергеевна Кузнецова, Константин Феликсович Тирронен, Данила Владимирович Панченко, Джулия Шрегель, Евгений Александрович Хижкин, Anastasiia Kuznetsova, Konstantin Tirronen, Danila Panchenko, Julia Schregel, Evgeny Khizhkin
2019 Transactions of the Karelian Research Centre of the Russian Academy of Sciences  
Показана возможность применения неинвазивного биологического материала в популяционно-генетических исследованиях крупных хищных млекопитающих на примере бурого медведя Кольско-Карельского региона. Сделана оценка эффективности методических приемов сбора и консервации проб. Материалом для исследования послужили 393 пробы экскрементов медведей, собранные на юге Мурманской области (Терский район) и в Республике Карелия. В лаборатории NIBIO Сванховд (Сванвик, Норвегия) выполнено выделение ДНК из
more » ... ыделение ДНК из образцов и проведено генетическое типирование по 8 микросателлитным локусам, в ходе которого были установлены генотипы 48 особей бурого медведя. Изучено влияние ряда факторов (способ консервации биологического материала, «свежесть» собранной пробы, композиция пищевых остатков и экспозиция биоматериала по отношению к солнечному свету) на сохранность ДНК в пробах и успешность получения генетического профиля особи. При совместной оценке изучаемых факторов достоверно значимое влияние на успешность амплификации имел состав пищевых остатков в пробе (р < 0,05). Установлено, что наличие ягод в экскрементах положительно влияет на консервацию молекулы ДНК и повышает результативность индивидуальной идентификации особи по микросателлитным локусам (наличие ПЦРпродуктов). Анализ каждого фактора независимо от остальных показал, что и «свежесть» собранной пробы, и метод ее консервации достоверно влияют на успешность амплификации и генотипирования. Наиболее пригодными для генетического анализа оказались пробы экскрементов, собранные в кратчайшие сроки после дефекации (свежие) и хранившиеся в солевом стабилизирующем растворе (Invitek). В результате исследования составлены рекомендации по использованию экскрементов животных в профильных генетических исследованиях. К л ю ч е в ы е с л о в а: бурый медведь; Ursus arctos; экскременты; неинвазивный сбор; метод; консервация; питание; выделение ДНК; микросателлитный анализ.
doi:10.17076/eb1038 fatcat:expheumrebee7iqmk2phpm7adm