VARIAN GENETIK Sardinella lemuru DI PERAIRAN SELAT BALI

Gde Raka Angga Kartika, Aida Sartimbul, W Widodo
2017 Jurnal Kelautan  
Sardinella lemuru is one of the fish species that dominate in the Bali Strait. Identification Sardinella lemuru with the others Sardinella in the Strait of Bali is based on morphological characteristics, whereas genetic identification of Sardinella lemuru in Bali Strait has not been done and variations genetic also unknown. This research aims to ascertain the type of Sardinella lemuru in the bali strait and Determine genetic variation and kinship based on cytochrome oxidase subunit (COI) gene.
more » ... ubunit (COI) gene. The method is performed by isolating DNA from fish organs and the results are amplified by the COI gene sequencing then performed to obtain the data sequence of Sardinella lemuru Bali Strait and analysed using the program MEGA 5.2. Results showed that lemuru in Bali Strait is Sardinella lemuru species with the degree of similarity BLAST analysis of 98-100%. 11 samples sequence of lemuru forming two large clad. The results also showed that the species of Sardinella lemuru and Sardinella longiceps different species with genetic distance> 0,019. ABSTRAK Sardinella lemuru merupakan salah satu spesies ikan yang mendominasi di perairan Selat Bali. Identifikasi Sardinella lemuru dengan sardinella lain di perairan Selat Bali hanya dibedakan berdasarkan secara morfologi, sedangkan identifikasi genetik belum pernah dilakukan dan variasi gentetik juga belum diketahui. Penelitian ini bertujuan memastikan jenis Sardinella lemuru di perairan Selat Bali dan mengetahui variasi genetik dan kekerabatannya berdasarkan gen Cythocrome oxidase sub unit 1 (COI). Metode yang dilakukan adalah dengan mengisolasi DNA dari organ tubuh ikan lemuru dan hasilnya diamplifikasi dengan gen COI, kemudian dilakukan skuensing untuk mendapatkan sekuen data ikan lemuru perairan Selat Bali dan urutan basa hasil skuensing dianalisis menggunakan program MEGA 5.2. Hasil menunjukan bahwa ikan lemuru di Selat Bali termasuk kedalam spesies Sardinella lemuru dengan tingkat kesamaan analisis BLAST adalah sebesar 98-100%. 11 sampel skuen ikan lemuru membentuk 2 kelompok besar. Hasil penelitian juga menunjukkan bahwa spesies Sardinella lemuru dan Sardinella longiceps merupakan speies ikan yang berbeda dengan jarak genetik >0,019 Kata Kunci: COI, Sardinella lemuru, Selat Bali PENDAHULUAN Perairan Selat Bali merupakan wilayah perairan yang memisahkan antara Pulau Jawa dan Bali. Perairan ini memiliki potensi perikanan yang sangat besar dan keunikan tersendiri. Beberapa komoditas perikanan yang sering dijumpai di Selat Bali adalah ikan lemuru (Sardinella lemuru), tongkol dan ikan layang. Sumberdaya perikanan lemuru merupakan sumberdaya perikanan yang paling dominan dan bernilai ekonomis di
doi:10.21107/jk.v10i1.1615 fatcat:ycdqjoxec5eipn7wubvrht3uou