Genetic polymorphism of merozoite surface protein-1 (MSP-1) block 2 allelic types in Plasmodium falciparum field isolates from mountain and coastal area in West Sumatera, Indonesia

Nuzulia Irawati
2011 Medical Journal of Indonesia  
Abstrak Latar belakang: Sampel P. falciparum dari lapangan dapat menampilkan bentuk dan jenis yang bervariasi. Penelitian ini bertujuan mengetahui keragaman alel MSP-1 blok 2 isolat P. falciparum yang berasal dari daerah pegunungan dan daerah pantai Sumatera Barat, Indonesia dan membandingkan keberadaan jenis-jenis alel dari kedua daerah pegunungan dan pantai. Metode : 56 sampel darah yang terinfeksi P. falciparum, diperoleh dari 27 penderita yang berobat pada Puskesmas di Kabupaten Solok
more » ... bupaten Solok Selatan yang merupakan daerah pegunungan dan 29 penderita yang datang berobat pada Puskesmas dari daerah pantai di kabupaten Pesisir Selatan, Sumatera Barat, Indonesia. Daerah-daerah yang mengapit sifat-sifat yang sangat polimorfi k, blok 2 MSP-1, ditentukan genotipnya melalui allele-specifi c nested PCR guna menganalisa populasi kepadatan parasit. Analisis urutan daerah-daerah polimorfi k dari MSP-1 juga dilakukan untuk mengidentifi kasi keanekaragaman alel di dalam populasi parasit. Hasil: Polimorfi sme alel yang beranekaragam dari MSP-1 diidentifi kasi pada isolat P. falciparum dari suatu daerah pegunungan dan daerah pantai di Sumatera Barat, Indonesia, dan kebanyakan infeksi ditemukan berupa infeksi campuran. Analisa urutan MSP-1 blok 2 mengungkapkan bahwa teridentifi kasi 16 alel berbeda untuk MSP-1 (3 untuk tipe K1, 2 untuk tipe MAD20 dan 2 untuk tipe RO33). Kesimpulan: Dari isolat lapangan P. falciparum yang dikumpulkan dari suatu daerah pegunungan dan daerah pantai di Sumatera Barat teridentifi kasi polimorfi fme genetik yang luas. Juga ditemukan tingkat infeksi campuran yang tinggi, sebagai derajat kemajemukan infeksi yang tinggi. Abstract Background: The fi eld isolates of P. falciparum may display variant forms and different frequencies. This study was designed to know the diversity of allelic type of MSP-1 block 2 among P. falciparum isolates collected in a mountain and a coastal area in West Sumatera, Indonesia, and compare mountain and coastal area. Methods: A total of 56 P. falciparum infected blood samples, collected from 27 patients attending local health facilities in South Solok district in a mountain region and 29 patients attending a local health facilities in South Coastal district region, West Sumatera, Indonesia were used in this study. The regions fl anking the highly polymorphic characters, block 2 for MSP-1, were genotyped by allele-specifi c nested-PCR to analyse the population diversity of parasite. Sequence analysis of the polymorphic regions of MSP-1 was also conducted to identify allelic diversity in the parasite population. Results: Diverse allelic polymorphism of MSP-1 was identifi ed in P. falciparum isolates from a mountain area and a coastal area in West Sumatera, Indonesia, and most of the infections were determined to be mixed infections. Sequence analysis of MSP-1 block 2 revelaled that 16 different alleles for MSP-1 (3 for K1 type, 2 for MAD20 type and 2 for RO33 type) were identifi ed. Conclusion: Extensive genetic polymorphism with diverse allele type was identifi ed in MSP-1 in P. falciparum fi eld isolates from a mountain and a coastal area. A high level of mixed infections was also obcserved, as was a high degree of multiplicity of infection. (Med J Indones 2011; 20:11-4)
doi:10.13181/mji.v20i1.422 fatcat:gfb5sggszzgffnvdtldkx5uiki