El Programa Munigestión se sustenta en el principio de cooperación mutua entre universidades y gobiernos locales (municipios, comunas y concejos deliberantes), en el cual aquellas no son simples prestadoras de servicio que establecen una relación de oferente–receptor. Este tipo de propuestas está basado en la construcción de conocimientosy saberes compartidos entre los diversos actores sociales comprometidos con el desarrollo de la región.