Modelling salmon migration as a mixture problem
Skip McKinnell
2018
Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences
Pulses of abundance in salmon migrations can arise from single populations arriving at different times, or from multiple populations with different timing characteristics, or as a combination of these. Daily observations typically record an aggregate measure of abundance passing some location rather than the abundances of the individual components. An objective method is described that partitions a compound migration into its component parts by exploiting differences in the characteristics of
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... ch pulse. Simulated data were used to demonstrate when greater model complexity may be desirable. Three case studies of increasing complexity (Chilko Lake sockeye salmon smolts, large adult Columbia River chinook salmon, Fraser River salmon test fishery) demonstrate how the model can be applied in practice. Results indicated that Chilko Lake smolts rarely emigrate to sea as a single pulse, that the dates used to distinguish the Spring run of chinook salmon in the Columbia River may be overestimating its abundance, and that pulses of sockeye salmon abundance in a Fraser River ocean test fishery in 2014 may have arisen from some factor other than population composition. Les impulsions d'abondance dans les migrations de saumon peuvent provenir de populations uniques arrivant à des moments différents, ou de populations multiples avec des caractéristiques temporelles différentes, ou comme une combinaison de celles-ci. Les observations quotidiennes enregistrent généralement une mesure globale de l'abondance passant par un endroit plutôt que l'abondance des composantes individuelles. Une méthode objective est décrite qui partitionne une migration composée en ses composantes en exploitant les différences dans les caractéristiques de chaque impulsion. Des données simulées ont été utilisées pour démontrer quand une plus grande complexité du modèle peut être souhaitable. Trois études de cas de complexité croissante (saumoneaux du saumon rouge du lac Chilko, grand saumon quinnat adulte du fleuve Columbia, pêche expérimentale au saumon dans le 2 15 20 25 30 Page 2 of 57 https://mc06.manuscriptcentral.com/cjfas-pubs Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences D r a f t fleuve Fraser) montrent comment le modèle peut être appliqué dans la pratique. Les résultats indiquent que les saumoneaux du lac Chilko émigrent rarement en mer en une seule impulsion, que les dates utilisées pour distinguer la migration printanière du saumon quinnat dans le fleuve Columbia surestiment son abondance, et que l'impulsion de l'abondance de 2014 du saumon rouge du fleuve Fraser dans une pêcherie océanique expérimentale peut avoir été causée par un facteur autre que la composition de la population. 3 35 40
doi:10.1139/cjfas-2017-0546
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