The use of RAPD markers to distinguish among juniper and cedar cultivars

Tom Hsiang, Junbin Huang
2000 Canadian Journal of Botany  
Two species of Chamaecyparis and six cultivars each of Juniperus chinensis L. and Juniperus scopulorum Sarg. (Cupressaceae) were subjected to random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis using seven primers. Unweighted pair group method with averages (UPGMA) and principal component analyses of genetic distances between cultivars showed that 42 polymorphic RAPD bands could distinguish among all cultivars and properly group them by species and genera. Where the origin of a specific juniper
more » ... tivar is uncertain, analysis of genetic distance can pinpoint close relatives. For example, we were unable to trace the origin of J. chinensis 'Alps', and we initially thought it was a mislabeled J. chinensis 'Blue Alps'. However, we found 'Alps' to be closer to J. chinensis 'Fairview' and 'Mountbatten' than to 'Blue Alps'. Similarly, 'Wichita Blue' has an unknown origin, but it had the highest genetic similarity with 'Medora'. Résumé : Les auteurs ont soumis deux espèces de Chamaecyparis et six cultivars du Juniperis chinensis L. et du Juniperus scopulorum Sarg. (Cupressaceae) respectivement, à l'analyse RAPD, à l'aide de sept amorces. Les analyses UPGMA et en composantes principales des distances génétiques entre les cultivars montrent que 42 bandes RAPD polymorphes permettent de distinguer les cultivars et de les regrouper adéquatement par espèce et par genre. Lorsque l'origine d'un cultivar spécifique de genévrier est incertaine, l'analyse de la distance génétique peut retracer les cv apparentés. Par exemple, les auteurs étaient incapables de retrouver l'origine du J. chinensis 'Alps', et pensaient qu'il s'agissait d'un J. chinensis 'Blue Alps' mal identifié. Cependant, le 'Alps' s'est avéré plus apparenté aux du J. chinensis 'Fairview' et 'Mountbatten', qu'au 'Blue Alps'. De même, le 'Wichta Blue' d'origine inconnue, montre une plus forte similitude génétique avec le 'Medora'.
doi:10.1139/cjb-78-5-655 fatcat:wo4y4vfxubg4ndb6uf2b7c7axa