Χαρακτηρισμός απομονώσεως του μύκητα Rhiroctonia solani από φυτά βαμβακιού, με κλασσικές και μοριακές μεθόδους:

Χαρίλαος Δημητρίου Μπαχάρης
2008
Ο μύκητας Rhizoctonia solani προκαλεί προφυτρωτικές και μεταφυτρωτικές τήξεις όπως επίσης και σήψη της ρίζας και του υποκοτυλίου φυταρίων βαμβακιού. Ο σκοπός αυτής της έρευνας ήταν ο χαρακτηρισμός στελεχών του μύκητα R. solani που απομονώθηκαν από ασθενή φυτά βαμβακιού στην Ελλάδα. Για το σκοπό αυτό συλλέχθηκαν από τις κύριες βαμβακοπαραγωγικές περιοχές της Ελλάδας 79 απομονώσεις του παθογόνου κατά τη διάρκεια της άνοιξης του 2007, από ασθενή φυτάρια βαμβακιού. Από τις 79 απομονώσεις που
more » ... ηκαν, οι 13 ήταν διπύρηνες και οι 66 πολυπύρηνες. Οι πολυπύρηνες απομονώσεις χαρακτηρίστηκαν χρησιμοποιώντας συμβατικά κριτήρια όπως ο ρυθμός ανάπτυξης, η παραγωγή σκληρωτίων, η μολυσματικότητα σε διάφορους ξενιστές και οι αντιδράσεις αναστόμωσης με χαρακτηριστικούς αντιπροσώπους των ομάδων αναστόμωσης. Επιπλέον, σε 33 από τις 66 πολυπύρηνες απομονώσεις, έγινε μοριακός χαρακτηρισμός βασισμένος στην ανάλυση των μη μεταγραφόμενων περιοχών του ριβοσωμικού DNA (rDNA-ITS). Η μοριακή ανάλυση κατέταξε την πλειονότητα αυτών των απομονώσεων στην ομάδα αναστόμωσης AG-4 (18 απομονώσεις στην υποομάδα HG-I, 1 απομόνωση στην υποομάδα HG-II και 7 απομονώσεις στην υποομάδα HG-III) ενώ 5 απομονώσεις ανήκαν στην ομάδα AG-7, μια στην ομάδα AG-2-1 και μία στην ομάδα AG-3. Τα δεδομένα αυτά ήταν σύμφωνα με το διαχωρισμό των απομονώσεων που έγινε με τη βοήθεια των αντιδράσεων αναστόμοσης. Τέλος, η ανάλυση της αλληλουχίας του ITS, η οποία πολλαπλασιάστηκε με τη χρήση της αλυσιδωτής αντίδρασης της πολυμεράσης (PCR), χρησιμοποιήθηκε για φυλογενετικές αναλύσεις.
doi:10.26262/heal.auth.ir.115533 fatcat:gnum736j3jc6dcv5svzzhe66re