Agradecimentos Agradeço primeiramente a Deus, por me permitir realizar este trabalho e concretizar este sonho. Ao meu estimado Orientador Arlei Marcili, por ter acreditado em mim e por ter me ensinado tudo o que sei hoje. Aos meus colegas da equipe de pesquisa, Juliana, Eduardo, e especialmente a Andréa, que tanto me auxiliou Aos meus colegas de laboratório. A todos os colegas e A todos os professores da Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Faculdade de Saúde Pública que contribuíram

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... e forma determinante para a minha formação; A minha amada família, meus pais Jair e Sandra, por todo amor e carinho de sempre. A minha irmã Cíntia, por toda a atenção e cumplicidade. A meus tios Sônia, Hermelindo, Júnior e Iraci, pelos conselhos e apoio. A meu primo Rafael, pela preocupação e atenção. Aos meus avôs Meires e Osmar, Maria e Elpídio, pelo amor descrito nos olhos e pelo abraço apertado que sinto a todo o momento. Ao meu namorado Thonny, pela compreensão e por todo seu apoio e carinho. Aos meus amigos pessoais, Mayra Mara, Laiz, Daniel, Eva. A CAPES pelo auxílio financeiro (bolsa) e a Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo -FAPESP-pelo financiamento do projeto "A verdadeira viagem de descobrimento não consiste em procurar novas paisagens, mas em ter novos olhos." Marcel Proust. ABSTRACT SAMPAIO, B. M. Intraspecific variation and biogeography of Brazilian isolates of Leishmania infantum chagasi based on nuclear and mitochondrial genes. [Variação intraespecífica e biogeografia de isolados brasileiros de Leishmania infantum chagasi baseado em genes nucleares e mitocondriais]. 2016. 56 f. Dissertação (Mestrado em Ciências) -Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade de São Paulo, São Paulo, 2016. The Leishmania species parasite mammals in the New World and have life cycles with alternating between vertebrates and invertebrates. Most species develops in blood-sucking arthropods, which may belong to different orders and families. Visceral leishmaniasis is an important zoonosis and has wild and domestic canids as important known reservoirs and genetic diversity of Leishmania infantum chagasi in Brazil is not yet known. Leishmaniasis is a severe disease with wide geographical distribution with an incidence of two million cases per year and 350 million people at risk in endemic areas. The aim of this study was to evaluate the intraspecific variation and biogeography based on nuclear and mitochondrial genes. The SSUrDNA markers, gGAPDH, cytochrome b, hsp 70, chitinase and ITS1rDNA were amplified, sequenced and compared phylogenetically by maximum parsimony and Bayesian methods in concatenated analysis. The variability of sequences was 0 to 1%, and the topology generated showed no intraspecific differences between Brazilian strains of Leishmania infantum chagasi and consequently biogeographic patterns. Although the results do not reflect the expected variability, the various sequences obtained will provide subsidies for the establishment and standardization of new diagnostic tests of canine visceral leishmaniasis.