AGRADECIMENTOS Ao meu orientador, Prof. Dr. Vitor Marcel Faça, por ter me dado a oportunidade de começar algo realmente novo, a confiança depositada para a execução do projeto e o apoio concedido nesses anos de estudo. Ao Prof. Adriano Sebollela, pela amizade e os conselhos proporcionados nestes últimos anos do doutorado, sempre tentando me ajudar a melhorar como estudante e ser humano. Ao Prof. Eduardo Brandt, pelo tempo e dedicação investido ao me ensinar a química da síntese de peptídeos,

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... os seus conselhos como professor que ajudaram muito na minha formação como cientista. Aos meus companheiros do Laboratório de Proteômica do Câncer, especialmente Guilherme Lanfredi e Edson Galdino, por fazer mais alegre o tempo de trabalho. À Carolina Thomé e Germano Ferreira, pela ajuda nos momentos-chaves do desenvolvimento do meu projeto de pesquisa. À Vanessa Caixeta e Giselle Villa Flor Brunoro, por sua grande amizade, por sempre me brindar apoio nos momentos mais difíceis e ajudar a me focar naquilo que é importante. À Ana Gaspari, Vannessa Espitia e Silvia Sánchez, por dividir seu tempo comigo nestes quatro anos de estância no Brasil e assim fazê-lo mais alegre e cheio de novidades culinárias e visitas ao cinema. À Niége Silva, pela ajuda desinteressada, a amizade espontânea e apoio incondicional. Seus conselhos sempre foram de muita ajuda para me fazer crescer como ser humano. À Andressa Barbán de Patrocínio, pelo carinho e apoio brindado ao longo de nossos anos como estudantes de doutorado. À Angelita Stabile, Wilson Rogerio, Edvaldo Ribeiro e Priscila Angelotti, graças a vocês conheci caminhos diferentes aos acadêmicos de muitos quilômetros corridos e risadas cheias de adrenalina que têm feito desta etapa da minha vida tão especial. Ao Dr. René Zahedi e ao seu grupo de pesquisa no ISAS, , que fizeram parte de minha vida de doutoranda um tempo curto, mas cheio de ensinamentos que me ajudaram a crescer profissional e pessoalmente. Ao Rafael Robles e à Sandra Palma, pelas noites de açaí com conversas amenas e diferentes que faz esquecer as preocupações do dia a dia. À Niele Mendes e à Raquel Campos por fazer de meus últimos meses de doutorado mais gostosos e cheios de diversão. A todos os alunos do Departamento de Bioquímica, por terem me ajudado sempre, alegres e de bom ânimo, sempre dispostos a me ensinar quando tenho precisado. Cacilda, pelo carinho e ajuda proporcionados, quando foi preciso. À central analítica da USP-SC e ao Prof. Dr. Emanuel Carrilho, pelo acesso ao espectrômetro de massas onde os dados proteômicos foram coletados. À FAPESP pelas bolsas e pelo apoio financeiro concedidos: doutorado (2011/22086-9); BEPEestágio no exterior (2015/07711-5) e ABSTRACT Pancreatic cancer kills more than 200 thousand people worldwide every year. Also, pancreatic cancer is considered one of the most aggressive adenocarcinomas and difficult to diagnose since it develops silently and presents a high genetic complexity. Consequently, the diagnostic is often late, when the pancreatic cancer has already metastasized and the treatment has only palliative purposes. The most frequent genetic alterations observed in pancreatic cancer are related to mutations in KRAS oncogene and CDKN2A, TP53, SMAD4 and BRCA2 tumor suppressor genes. In addition to these known frequent mutations, growth factors such as TGBβ and EGF play important roles in pancreatic cancer progression and metastasis. Interestingly, TGB-β and EGF are also inducers of the Epithelial to Mesenchymal Transition (EMT), in which epithelial cells lose their intracellular contacts and acquire migratory capacities. Therefore, EMT is considered one of the mechanisms responsible for tumor progression and metastasis in adenocarcinomas in addition of being correlated to the process of generating cancer stem cells. In our present study, pancreatic cancer cell line PANC-1 was induced to EMT by using growth factors TGF-β1 or TGF-β2 and EGF. Both molecular and functional properties, such as invasion and migration, were evaluated in PANC-1 cells undergoing EMT and confirm the induction. Two conditions of EMT induction were properly established and in-depth quantitative proteomic analysis based on stable isotope labeling in cell culture (SILAC) followed by cellular and protein fractionation were assessed. In total, 5.000 proteins were identified and most of them were accurately quantified in duplicate experiments. Thirty-seven proteins were selected as differentially expressed with statistical significance, and were related mainly with biogenesis, adhesion and apoptosis processes. Interaction network analysis showed that regulated proteins were predominantly participating in signaling pathways linked to extracellular matrix organization, alternative splicing and apoptosis regulation. Phosphoproteome analysis was done using TGF-β1 as EMT-inductor agent on PANC-1 cells and ERLIC strategy for phosphopeptides enrichment. In total, were identified 5.965 non-redundant phosphopeptides corresponding to approximately 2.250 analyzed phosphoproteins, thereof 2.053 were quantified in at least two replicates. At comparison, were identified 61 regulated phosphopeptides belonging to 55 phosphoproteins, which were related with mRNA regulation processes and signialing pathways linked to cellular adhesion. In conclusion, our study highlighted potential new targets for EMT inhibition, metastasis control or to help in pancreatic cancer diagnosis, when careful validated.