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La cryo-microscopie, une alternative à la cristallographie aux rayons X ?

Jean A. Boutin, Zhuolun Li, Laurent Vuillard, Catherine Vénien-Bryan
2016 M S.Médecine Sciences  
Il est ainsi possible de calculer relativement rapidement des structures à haute résolution de molécules biologiques dont l'étude résiste aux méthodes plus classiques comme la diffraction des rayons X  ...  Certaines de ces nouvelles structures résolues grâce à la cryo-microscopie électronique révèlent pour la première fois le fonctionnement précis de mécanismes essentiels au bon déroulement physiologique  ...  Some of these new structures resolved through cryo-electron microscopy revealed for the first time the precise operation of essential mechanisms necessary for the good physiological process of a cell.  ... 
doi:10.1051/medsci/20163208025 pmid:27615185 fatcat:zglzacv4f5dknnvujey25yssyi

Les protéines CCN : quand multimodulaire rime avec multifonctionnel

Bernard Perbal
2002 M S.Médecine Sciences  
des séquences amino-proximales des protéines CCN Décalage imposé pour aligner les séquences CCN et IGFBP Alignement des séquences amino-proximales des IGFBP Q R C P P Q C P G R C P A T P P T C A P  ...  des protéines de la famille CCN L'alignement des séquences primaires ( Figure 1 ) montre la très grande identité structurale des différentes protéines CCN.  ... 
doi:10.1051/medsci/20021867745 fatcat:5lsug63eebcwpebgkrnoxzbkf4

Approximate String Matching: Theory and Applications (La Recherche Approchée de Motifs : Théorie et Applications) [article]

Ibrahim Chegrane
2017 arXiv   pre-print
We propose a solution for peers and multiple sequences alignment.  ...  We give a new solution better in practice than all the previous proposed solutions. 3) The problem of the alignment of biological sequences can be interpreted as an approximate string matching problem.  ...  Pour plus de détails sur les méthodes et les techniques d'alignement des séquences biologiques, référer à [10, 11, 125, 12] . Figure 7 . 1 - 71 Alignement de deux séquences d'ADN.  ... 
arXiv:1701.08688v1 fatcat:lsttpvrsi5fffhv6najvd4suly

Le profilage ribosomique

Juliana Blin, Emiliano P. Ricci
2016 M S.Médecine Sciences  
Une fois les alignements obtenus, l'expérimentateur peut mesurer la densité de ribosomes par molécule d'ARNm en calculant le ratio entre le nombre de séquences protégées par les ribosomes pour un ARNm  ...  En effet, l'analyse fine de la phase de lecture des ribosomes sur une région codante nécessite l'alignement d'un grand nombre de séquences sur le transcrit d'intérêt.  ... 
doi:10.1051/medsci/20163210018 pmid:27758749 fatcat:slbeviaeufdxdcflwvojirfwzq

The Mammalian Epigenome

Bradley E. Bernstein, Alexander Meissner, Eric S. Lander
2007 Cell  
Cette analyse démontre que ce motif, mais aussi l' ARN en général, peut facilement ajuster sa séquence et même sa structure pour répondre aux contraintes locales, sans impact significatif sur l'environnement  ...  Une application développée expressément pour l'étude de motifs d'ARN, et utilisée dans les travaux présents, est ensuite décrite.  ...  & Methods section for search parameters).  ... 
doi:10.1016/j.cell.2007.01.033 pmid:17320505 fatcat:cgwwcy67p5a73mfu6bqytic3xy

Innovation bio-inspirée : modélisation d'un processus interdisciplinaire de conception biomimétique outillé et intégration d'un nouvel acteur, le Biomiméticien

Eliot Graeff, Nicolas Maranzana, Améziane Aoussat
2020 Zenodo  
The recommendation of its practical activities, including concepts, methods and tools derived from biology, then leads to the definition of the skills of this new member of the biomimetic design teams.  ...  More specifically, the absence of professionals trained in biomimetic design and life sciences makes access and analysis of biological data particularly complex.  ...  des systèmes biologiques Biomimetics Analyzer of Biologically Expertized literature for Engineers (BABELE) (Fayemi et al., 2015) , visant à faciliter la sélection de modèles biologiques d'intérêt par  ... 
doi:10.5281/zenodo.4276454 fatcat:fopzqbth5bb2rfisxb4nupgrfe

Leçons biochimiques et statistiques de l'évolution du virus SARS-CoV-2 : nouveaux chemins pour combattre les virus

Nicolas Cluzel, Amaury Lambert, Yvon Maday, Gabriel Turinici, Antoine Danchin
2020 Comptes Rendus. Biologies  
L'un des moyens possibles pour le virus d'échapper au contrôle par le CTP serait d'infecter des cellules qui ne se multiplient pas, comme les neurones.  ...  Dans la lutte contre la propagation de la COVID-19 l'accent est mis sur la vaccination, d'une part, et sur le redéploiement de traitements utilisés pour d'autres usages, d'autre part.  ...  Acknowledgements AL would like to thank the Centre Interdisciplinaire de Recherche en Biologie (CIRB, Collège de France) for its funding, as well as the members of the SMILE (Stochastic Models for the  ... 
doi:10.5802/crbiol.16 pmid:33108121 fatcat:jzdeuvz5ojf65jwfvflxywey3u

Évolution et adaptation fonctionnelle des arbres tropicaux : le cas du genre Guibourtia Benn

Félicien Tosso
2018 BOIS & FORETS DES TROPIQUES  
d'une nouvelle espèce.  ...  (Fabaceae-Detarioideae) comme modèle biologique afin de comprendre les mécanismes historiques, biologiques et environnementaux à l'origine de la diversité de ce genre.  ...  Sequences were aligned in MAFFT 7 (Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences: http://mafft.cbrc.jp/alignment/software/).  ... 
doi:10.19182/bft2018.337.a31632 fatcat:hmss7o6djvajxjrpu5656zubey

Evolution and development of neural controllers for locomotion, gradient-following, and obstacle-avoidance in artificial insects

J. Kodjabachian, J.-A. Meyer
1998 IEEE Transactions on Neural Networks  
Deux types de travaux reposant sur ces méthodes sont ainsi décrits, tout deux utilisant des algorithmes évolutionnistes. Ils différent sur l'utilisation des résultats.  ...  Biol. 205 1389-1409 Meyer J-A and Guillot A In press Biologically-inspired robots. In Siciliano B and Khatib O editors, Handbook of Robotics.  ...  This study was partly funded by the post-doctoral fellowship of the french "Direction Generale de l'Armement" (DGA) for E. de Margerie.  ... 
doi:10.1109/72.712153 pmid:18255767 fatcat:iy4zjzgcjzc6pmwoqp3c5xpfga

La vie, un objet pour l'anthropologie ?

Perig Pitrou
2014 L'Homme (En ligne)  
réitèrent à l'apparition d'un nouvel être vivant.  ...  psychopompe de ces instruments et la méthode de fabrication de leur membrane.  ... 
doi:10.4000/lhomme.23786 fatcat:u4wcl6yunjaxrgyxtw76rwtx2y

Réalisation de micro-antennes souples implantables pour l'imagerie par résonance magnétique du petit animal

Magdalèna Couty, Jean-Christophe Ginefri, Marion Woytasik, Anne Rubin, Emile Martincic, Marie Poirier-Quinot, Luc Darrasse, Fawzi Boumezbeur, Franck Lethimonnier, Michael Tatoulian, Elisabeth Dufour-Gergam
2012 Instrumentation Mesure Métrologie  
Jean-Christophe Ginefri pour sa patience et sa pédagogie, Mme Marie Poirier-Quinot Martin pour sa joie de vivre, et M. Luc Darrasse qui a de plus présidé le jury.  ...  Emile Martincic pour la réalisation des masques de lithographie et les procédés PDMS ; à M. Mehdi Ammar pour les mesures AFM et l'initiation à la microfluidique ; à M.  ...  Optimisation de l'alignement des motifs et du collage PDMS/PDMS La structure double face du RMLT implique un alignement des motifs des pistes.  ... 
doi:10.3166/i2m.12.1-2.9-35 fatcat:6gef232wh5h73ckngdxdbmhmty

α-Helix recognition by rigid-rod β-barrel ion channels with internal arginine-histidine dyads in polarized bilayer membranes

Nathalie Sordé, Stefan Matile
2002 Journal of Supramolecular Chemistry  
UNIVERSITÉ DE GENÈVE FACULTÉ DES SCIENCES Département de chimie organique Professeur S.  ...  "On Selectivity and Sensitivity of Synthetic Multifunctional Pores as Enzymes Sensors: Discrimination between ATP and ADP and Comparison with Biological Pores". Sordé, N.; Matile S.  ...  de la séquence peptidique de protéines naturelles, plutôt que de la production d'une nouvelle entité.  ... 
doi:10.1016/s1472-7862(03)00073-x fatcat:itraj54ixzc6rjg2eo24irkx2y

The anâtaxis phylogenetic reconstruction algorithm

Bernhard Pascal Sonderegger, Bastien Chopard, Gabriel Bittar
2007
BAIROCH, professeur adjoint (Faculté de médecine, Section de médecine fondementale, Département de biologie structurale et bioinformatique) et N.  ...  SALAMIN, docteur (Université de Lausanne, Faculté de biologie et de medecine Département d'écologie et évolution, Lausanne, Suisse), autorise l'impression de la présente thèse, sans exprimer d'opinion  ...  Il a toujours fait son possible pour m'aider sans avoir peur de se 'salir les mains' avec des taches pénibles comme l'alignement manuel des séquences.  ... 
doi:10.13097/archive-ouverte/unige:496 fatcat:qqx3mhrc4nfkzp2hya4r4wbrke

Development and validation of a novel method for clustering protein sequences and detecting diagnostic motifs

Nadine Zangger, Ron David Appel, Frédérique Lisacek
2007
Je les remercie pour avoir généreusement partagé leur savoir et leur expérience dans le domaine de l'analyse de séquences, pour le foisonnement d'idées et les nombreuses discussions qui ont jalonné les  ...  Je remercie Desmond Higgins et Christian Pellegrini, membres de mon jury de thèse, pour l'intérêt qu'ils ont porté à mon travail, pour leurs questions et critiques constructives lors de la soutenance.  ...  La localisation de ces motifs peut servir de point de départ pour de plus amples investigations. 0.3 CliPS: une nouvelle méthode pour classier automatiquement les protéines L'algorithme de CliPS a été  ... 
doi:10.13097/archive-ouverte/unige:526 fatcat:zxygbauzm5a3jjgrgleq6axdr4

Actes des 27 es Journées Francophones d'Ingénierie des Connaissances IC 2016 Nathalie Pernelle Présidente du comité de programme Comités Comité d'organisation Avant-propos

Sandra Bringay, Sandra Bringay, Mike Donald, Tapi Nzali, Bertrand Braunschweig, Inria -Rennes Atlantique, Jean-Pierre Evain, Alain Léger, Alain, Université Mille, Bernard Claude, Lyon (+6 others)
unpublished
Remerciements Ce travail a bénéficié partiellement d'une aide de l'État gérée par l'Agence Nationale de la Recherche au titre du programme « Investissements d'Avenir » portant la référence ANR-10-LABX-  ...  Remerciements Les auteurs remercient les étudiants ayant participé au développement de l'outil : Max Devaud, Thomas Filiol, Baptiste Belot et Clément Hemeury.  ...  -paramétrer le processus de recueil en définissant de nouvelles combinaisons de mots-clés pour Google News.  ... 
fatcat:xugt3pyogjb6fe4mnkbr2dtily
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