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CASIMIR & ENFIN

John Hancock, John Hancock
2011 Nature Precedings  
ENFIN (Experimental Network for Functional Integration) About  ENFIN is a virtual institute, formed to enable systemslevel integration of experimental results.  ...  scientific integration of mouse genetics and other databases relevant to functional genomics, inside and outside Europe • Coordinated efforts to standardise data structure, description and exchange  ...  ENFIN Registry • Systems Biology domain DBs • Curate web services Chrysanthi Ainali  ... 
doi:10.1038/npre.2011.6158 fatcat:thxyu563qbgchemrsu46h5nbxa

CASIMIR & ENFIN

John Hancock, John Hancock
2011 Nature Precedings  
ENFIN (Experimental Network for Functional Integration) About  ENFIN is a virtual institute, formed to enable systemslevel integration of experimental results.  ...  scientific integration of mouse genetics and other databases relevant to functional genomics, inside and outside Europe • Coordinated efforts to standardise data structure, description and exchange  ...  ENFIN Registry • Systems Biology domain DBs • Curate web services Chrysanthi Ainali  ... 
doi:10.1038/npre.2011.6158.1 fatcat:zg7qycg4pfbwxlhyliznuduod4

Sommes-nous enfin dotés d'un cérébrascope et si oui, pour quoi faire ?

Claudine Tiercelin
2010 Les conférences du Collège de France  
Price Cathy J. et Friston Karl J., « Functional Ontologies for Cognition: The Systematic Definition of Structure and Function », Cognitive Neuropsychology , vol. 22, n o 3, 2005, p. 265-267 [doi:10.1080  ...  An Investigative Report », Esquire , 18 mai 2009, p. 120-125.  ... 
doi:10.4000/conferences-cdf.342 fatcat:55dg5cu4drarta7w7fgxefrzwa

Functional Genomics Assistant (FUGA): a toolbox for the analysis of complex biological networks

Ignat Drozdov, Christos A Ouzounis, Ajay M Shah, Sophia Tsoka
2011 BMC Research Notes  
targets using concepts of systems biology.  ...  Conclusion: FUGA offers a simple and customizable framework for network analysis in a variety of systems biology applications. It is freely available for individual or academic use at  ...  Acknowledgements We thank members of the King's College London Centre for Bioinformatics (KCBI), and in particular Chrysanthi Ainali, for ideas, test cases, and feedback.  ... 
doi:10.1186/1756-0500-4-462 pmid:22035155 pmcid:PMC3214203 fatcat:jnwf4zc6urbppaizrt262qgi2e

Heart failure: a complex clinical process interpreted by systems biology approach and network medicine

Goerge E. Louridas, Katarina G. Lourida
2014 Anadolu Kardiyoloji Dergisi/The Anatolian Journal of Cardiology  
Systems biology is founded on the principles of integrative computational analysis and on the data from genetic and molecular components.  ...  Systems biology detects and evaluates specific networks from molecular, cellular and tissue elements, and assesses their influence on the appearance of clinical phenotypes.  ...  Systems biology directions in heart failure The classical two directions of systems biology are important for defining the integrated processes of various biological networks in cells, tissues and organs  ... 
doi:10.5152/akd.2014.5091 pmid:24566513 fatcat:67soxgzv4vdmzih665atooot7y

Les sciences et technologies du vivant au Cemagref Situation et perspectives

C SCHMIDTLAINE
2002 Natures sciences sociétés  
Elle a port6 sur les an&es 1996 & 1998.  ...  Biologie integrative. Universite de Montpellier-Il. Directeur : Andre Charrier. Sciences du &g&al : du gene a I'ecosysteme. Universite de kis-Sud (Orsay), Paris-XI. Directeur : Pierre Gadal.  ... 
doi:10.1016/s1240-1307(02)80146-7 fatcat:asgxvshbcbc2rcczikkh64xfiq

Review of the selected proceedings of the Fifth International Workshop on Data Integration in the Life Sciences 2008

Amos Bairoch, Sarah Cohen-Boulakia, Christine Froidevaux
2008 BMC Bioinformatics  
Acknowledgements DILS 2008 was kindly sponsored by the University of Paris-Sud 11, Microsoft Research who also made available their conference management system, the ENFIN network of Excellence, and the  ...  We are very grateful to the University of Evry for hosting and supporting DILS, the MAISEL school for providing rooms for students, and the Genopole-Evry for its help in the local organization.  ...  : 1 Swiss Institute of Bioinformatics (SIB) and Department of Structural Biology and Bioinformatics, University of Geneva, Switzerland and 2 Laboratoire de Recherche en Informatique (LRI), CNRS UMR 8623  ... 
doi:10.1186/1471-2105-9-s8-s1 pmid:18673525 pmcid:PMC2500092 fatcat:2gxotyt5bfdybnofgg2s6m5txq

iHOP web services

J. M. Fernandez, R. Hoffmann, A. Valencia
2007 Nucleic Acids Research  
Here we describe a public programmatic API that enables the integration of main iHOP functionalities in bioinformatic programs and workflows.  ...  ACKNOWLEDGEMENTS Funding to pay the Open Access publication charges for this article was provided by ENFIN Network of Excellence (LSHG-CT-2005-518254).  ...  ENFIN Spindle proteins tool, CARGO framework) are currently using these iHOP web service APIs in different biological and technical contexts. http://www.pdg.cnb.uam.es/ecid/ COMBIO ENFIN (Enabling Systems  ... 
doi:10.1093/nar/gkm298 pmid:17485473 pmcid:PMC1933131 fatcat:4leifunz6rb6jau66jdhi7ab5u

Espace et temps dans les sciences du vivant : nouvelles perspectives pour la recherche en didactique

Maryline Coquidé, Michèle Dell'Angelo, Stanislas Dorey, Corinne Fortin, Magali Gallezot, Sandrine Henocq, Faouzia Kalali, Jean-Marc Lange, Guy Rumelhard
2011 Journal of research in science and technology education  
Pour rendre compte de ces multiples interactions, la biologie intégrative s'appuie sur une théorie des systèmes complexes (Kitano, 2002 ; Liu, 2005) .  ...  Les données de la biologie moléculaire, de la biologie de l'évolution et du développement placent les processus évolutionnistes de façon intégrative au coeur de la biologie.  ...  Finally an overview of new education and research needs spurred by the advances of integrative biology is offered.  ... 
doi:10.4000/rdst.512 fatcat:g7icy32mp5es5ovbks4z7dlmfy

Biotechs : de la recherche académique au monde industriel

Françoise Xavier
2007 La Revue pour l'histoire du CNRS  
Très structurée, Ecrin a une équipe de les actions, structures souples, de durée déterminée, pour répondre à des demandes, clairement exprimées, ponctuelles, individuelles ou collectives, d'adhérents ou  ...  Depuis mars 2005, j'ai intégré le Laboratoire de mathématiques appliquées aux systèmes de l'École centrale Paris pour développer des projets de recherche entre mathématiciens, biologistes, biophysiciens  ...  For thirteen years, Francoise Xavier had been in charge of the club "Biotechnologies" and then responsible for the "Biology, biotechnologies and health" field within ECRIN association (Exchange and Collaboration  ... 
doi:10.4000/histoire-cnrs.1976 fatcat:cd63vwargjehddrqxqshtbgvaq

Evaluation of text-mining systems for biology: overview of the Second BioCreative community challenge

Martin Krallinger, Alexander Morgan, Larry Smith, Florian Leitner, Lorraine Tanabe, John Wilbur, Lynette Hirschman, Alfonso Valencia
2008 Genome Biology  
An overall improvement in terms of balanced precision and recall was observed for the best submissions for the gene mention (F score 0.87); for the gene normalization task, the best results were comparable  ...  Genome sciences have experienced an increasing demand for efficient text-processing tools that can extract biologically relevant information from the growing amount of published literature.  ...  This article has been published as part of Genome Biology Volume 9 Supplement 2, 2008: The BioCreative II -Critical Assessment for Information Extraction in Biology Challenge.  ... 
doi:10.1186/gb-2008-9-s2-s1 pmid:18834487 pmcid:PMC2559980 fatcat:oebtobhdtbfexgyrmymmy7o6vi

La biologie moléculaire est-elle modulaire ? De la génomique à la biologie synthétique

Vincent Schächter
2009 Bulletin d'histoire et d'épistémologie des sciences de la vie  
The advent of synthetic biology has recently caused an interesting constructivist turn in this quest for modularity in biological processes.  ...  Enfin, nous évoquons le tournant constructiviste inédit que prend cette quête de modularité avec l'essor de la biologie synthétique.  ... 
doi:10.3917/bhesv.161.0029 fatcat:kvqy5aqbazg45hcobemexiwiki

La recherche dans le domaine des sciences de la vie au RIKEN

Sophie Vriz
2002 M S.Médecine Sciences  
-2002 Center for Developmental Biology, directeur Masatoshi Takeichi Tableau I.  ...  Par exemple, le département de recherche sur les protéines intègre le plus grand laboratoire de RMN (résonance magnétique nucléaire) du monde (16 systèmes de RMN).  ... 
doi:10.1051/medsci/200218101027 fatcat:qy72qhyz5zfprgf77e2mixqqpm

Biologie des systèmes appliqués aux cancers

Emmanuel Barillot, Laurence Calzone, Andrei Zinovyev
2009 M S.Médecine Sciences  
Enfin, elle intègre nos connaissances préalables sur le fonctionnement du système.  ...  Pourquoi une biologie des systèmes appliqués aux cancers ?  ...  Enfin, elle intègre nos connaissances préalables sur le fonctionnement du système.  ... 
doi:10.1051/medsci/2009256-7601 pmid:19602357 fatcat:mbzwtwtuu5cbpjgev5qurridzi

Biologie et génétique du développement

Spyros Artavanis-Tsakonas
2010 Annuaire du Collège de France : Résumé Des Cours et Travaux  
Annuaire du Collège de France 2008-2009 Biologie et génétique du développement Spyros Artavanis-Tsakonas Plan Texte intégral Enseignement Cours : La biologie du développement, génétique et biologie  ...  and Stability and is essential for Mouse Development », Mol.  ... 
doi:10.4000/annuaire-cdf.308 fatcat:fyswq55xhjdgvbj5af3dswd26y
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